Protein–RNA interactions for Protein: Q9R0N8

Syt6, Synaptotagmin-6, mousemouse

Predictions only

Length 511 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Syt6Q9R0N8 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 1110008P14Rik-201ENSMUST00000048792 680 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Syt6Q9R0N8 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Dnajc19-202ENSMUST00000108195 659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Smagp-202ENSMUST00000172334 952 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Asf1a-205ENSMUST00000219282 1150 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Ppa2-203ENSMUST00000122334 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Macrod2-207ENSMUST00000110067 4730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Fam193b-201ENSMUST00000021957 4341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Rapgef1-201ENSMUST00000091146 6212 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Nab2-202ENSMUST00000099157 2311 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Sntb1-202ENSMUST00000110200 1225 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.97■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Syt6Q9R0N8 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Hcn4-201ENSMUST00000034889 6118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Ccdc112-201ENSMUST00000072835 2801 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Syt6Q9R0N8 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms