Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZS0

Col4a3, Collagen alpha-3(IV) chain, mousemouse

Predictions only

Length 1,669 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Col4a3Q9QZS0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Ostc-201ENSMUST00000043937 1067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Elf2-203ENSMUST00000108051 2514 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC23.54■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 AC115037.1-201ENSMUST00000223391 2173 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Hebp2-202ENSMUST00000213153 968 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Asph-201ENSMUST00000038564 1174 ntTSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Asph-205ENSMUST00000098275 1007 ntTSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Wnt2-201ENSMUST00000010941 2255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Col4a3Q9QZS0 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Pkig-202ENSMUST00000099105 640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Irak1-207ENSMUST00000114360 2441 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.35
Col4a3Q9QZS0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Emc10-201ENSMUST00000118515 1662 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Gm20548-204ENSMUST00000174528 791 ntTSL 3 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Arx-202ENSMUST00000113947 2454 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Ttc14-206ENSMUST00000196975 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Porcn-203ENSMUST00000089402 1839 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Col4a3Q9QZS0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Col4a3Q9QZS0 Svbp-201ENSMUST00000030395 733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.3 ms