Protein–RNA interactions for Protein: Q9QZC1

Trpc3, Short transient receptor potential channel 3, mousemouse

Predictions only

Length 836 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Trpc3Q9QZC1 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Terf2-202ENSMUST00000068421 2667 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.92■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Mlx-201ENSMUST00000017945 1965 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Trpc3Q9QZC1 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Trpc3Q9QZC1 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC22.8■■□□□ 1.24
Trpc3Q9QZC1 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 68.2 ms