Protein–RNA interactions for Protein: Q9QYE3

Bcl11a, B-cell lymphoma/leukemia 11A, mousemouse

Predictions only

Length 773 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Bcl11aQ9QYE3 Pdss1-201ENSMUST00000053729 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Fam241a-201ENSMUST00000057198 1607 ntTSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Tada2b-201ENSMUST00000031097 3791 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Paqr4-201ENSMUST00000024702 2507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 1700003F12Rik-202ENSMUST00000109709 704 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 1700003F12Rik-201ENSMUST00000045116 704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Ndfip2-206ENSMUST00000181969 2532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Pcgf5-210ENSMUST00000225411 1626 ntAPPRIS P5 BASIC26.25■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Fam171a2-201ENSMUST00000049057 3118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Sertad4-204ENSMUST00000155579 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Rasgrp2-201ENSMUST00000035716 2219 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.24■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Cd248-201ENSMUST00000070630 2560 ntAPPRIS P1 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC26.23■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Zxdc-201ENSMUST00000045740 1612 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Wt1-209ENSMUST00000213301 1554 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 E4f1-205ENSMUST00000226941 2642 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Fam3c-201ENSMUST00000081288 1487 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Bmp6-201ENSMUST00000171970 3593 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.22■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Coro1b-201ENSMUST00000008893 1888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.21■■□□□ 1.79
Bcl11aQ9QYE3 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Rbmxl2-201ENSMUST00000098135 1472 ntAPPRIS P1 BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Gm7432-201ENSMUST00000210343 879 ntBASIC26.2■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.2■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Nadk2-201ENSMUST00000067760 3731 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Mapkap1-202ENSMUST00000113124 1758 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Brsk2-201ENSMUST00000018971 4049 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Sirt1-201ENSMUST00000020257 3905 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.19■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Gas7-203ENSMUST00000108681 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Ell2-205ENSMUST00000222194 434 ntTSL 3 BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Fam120aos-201ENSMUST00000180775 1780 ntTSL 1 (best) BASIC26.18■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Tada2b-202ENSMUST00000119916 1321 ntTSL 5 BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Mmp14-201ENSMUST00000089688 2596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Khsrp-201ENSMUST00000007814 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.17■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Odc1-201ENSMUST00000171737 2208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Sybu-208ENSMUST00000228057 3026 ntAPPRIS ALT2 BASIC26.16■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Mta1-201ENSMUST00000009099 2826 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC26.15■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Kcmf1-204ENSMUST00000204598 1743 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Mum1-201ENSMUST00000020365 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.78
Bcl11aQ9QYE3 Glra1-202ENSMUST00000102716 2390 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.14■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Ltbp3-201ENSMUST00000081496 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.14■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Tmod1-201ENSMUST00000107773 3158 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Sh2b3-203ENSMUST00000118580 2393 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.13■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Gm5784-202ENSMUST00000220896 2016 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Itpka-201ENSMUST00000028758 1818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Trpc4ap-201ENSMUST00000041059 3204 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Pm20d2-202ENSMUST00000119167 1339 ntTSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 U2af2-201ENSMUST00000005041 2183 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.12■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Tnpo2-207ENSMUST00000211601 2941 ntTSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Tor1a-201ENSMUST00000028200 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Tbc1d25-201ENSMUST00000039892 2648 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.11■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Fank1-204ENSMUST00000209511 1392 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Gm10300-201ENSMUST00000094662 2296 ntAPPRIS P1 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Rasgef1a-201ENSMUST00000164960 3284 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Hoxd4-201ENSMUST00000047904 2560 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Arfrp1-209ENSMUST00000170190 2483 ntTSL 5 BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.1■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Deaf1-209ENSMUST00000211537 2882 ntTSL 2 BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Cep57-209ENSMUST00000148086 2467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Paics-203ENSMUST00000120912 2345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Bcl11aQ9QYE3 Nkx2-4-201ENSMUST00000067020 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.09■■□□□ 1.77
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 83.4 ms