Protein–RNA interactions for Protein: Q9QY61

Irx4, Iroquois-class homeodomain protein IRX-4, mousemouse

Predictions only

Length 515 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Irx4Q9QY61 Smarcad1-211ENSMUST00000204696 734 ntTSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Irx4Q9QY61 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Fgfrl1-201ENSMUST00000013633 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Zyg11a-202ENSMUST00000106690 2421 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Rab43-203ENSMUST00000078647 4605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Irx4Q9QY61 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Pou2f2-206ENSMUST00000108418 1934 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Gm28052-201ENSMUST00000150388 380 ntTSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Bcl7b-202ENSMUST00000111187 564 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Ccdc50-202ENSMUST00000096127 1096 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Ankrd60-202ENSMUST00000119453 1084 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Serpinb6a-201ENSMUST00000017188 1504 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Magi2-205ENSMUST00000197354 4785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Dtnb-216ENSMUST00000173736 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
Irx4Q9QY61 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 AC117232.3-201ENSMUST00000217817 338 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Syap1-201ENSMUST00000033723 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Gm8093-201ENSMUST00000128935 1892 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Pbx1-206ENSMUST00000176790 1828 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Aadat-201ENSMUST00000079472 1972 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Gm11599-201ENSMUST00000118720 878 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Gm28592-201ENSMUST00000186844 741 ntTSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Cbfb-204ENSMUST00000109395 2709 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.1■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Map2k7-207ENSMUST00000110999 1578 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Eif2b4-202ENSMUST00000114603 1966 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
Irx4Q9QY61 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.8 ms