Protein–RNA interactions for Protein: Q9JJ72

Rprm, Protein reprimo, mousemouse

Predictions only

Length 109 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RprmQ9JJ72 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.24■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.23■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Gm9812-201ENSMUST00000061934 968 ntBASIC17.23■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.23■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Mtor-201ENSMUST00000057580 1003 ntTSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC17.22■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Hoxb3-201ENSMUST00000055334 1890 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.22■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Nup153-201ENSMUST00000021803 6109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
RprmQ9JJ72 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Cobll1-204ENSMUST00000112430 4917 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Fam89a-201ENSMUST00000055257 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Gm4799-201ENSMUST00000095396 657 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Gm16286-202ENSMUST00000125127 1683 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Olfm1-204ENSMUST00000113920 2513 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Ptpn18-206ENSMUST00000188972 414 ntTSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Kras-207ENSMUST00000203147 817 ntTSL 5 BASIC17.18■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.18■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC17.17■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC17.17■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Nphp1-202ENSMUST00000110357 2296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.17■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC17.16■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC17.16■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.16■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC17.15■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.15■□□□□ 0.34
RprmQ9JJ72 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Krt1-201ENSMUST00000023790 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 E530011L22Rik-202ENSMUST00000216791 2007 ntTSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.14■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Snrpe-202ENSMUST00000164574 597 ntTSL 3 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC17.13■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.13■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Pkmyt1-201ENSMUST00000024701 2039 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC17.13■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
RprmQ9JJ72 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.12■□□□□ 0.33
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 88.2 ms