Protein–RNA interactions for Protein: Q9ERB0

Snap29, Synaptosomal-associated protein 29, mousemouse

Predictions only

Length 260 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Snap29Q9ERB0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC20.12■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC20.11■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.1■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Bcl11b-202ENSMUST00000109887 2522 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.09■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.81
Snap29Q9ERB0 Chn2-201ENSMUST00000046856 2418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Kdm3b-204ENSMUST00000224715 2032 ntBASIC20.08■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.08■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.07■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Agap2-201ENSMUST00000039259 5633 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC20.06■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Zcchc14-201ENSMUST00000046386 7444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Pcbd2-201ENSMUST00000021958 544 ntTSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.05■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Akt1s1-201ENSMUST00000054343 1592 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.04■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.03■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Gm6311-201ENSMUST00000073790 878 ntBASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.8
Snap29Q9ERB0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.02■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Paqr6-203ENSMUST00000147948 837 ntTSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Znrf1-207ENSMUST00000173506 1238 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.01■□□□□ 0.79
Snap29Q9ERB0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.01■□□□□ 0.79
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 24.1 ms