Protein–RNA interactions for Protein: Q9DB91

Med29, Mediator of RNA polymerase II transcription subunit 29, mousemouse

Predictions only

Length 199 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Med29Q9DB91 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med29Q9DB91 Sox1-201ENSMUST00000180353 4832 ntAPPRIS P1 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med29Q9DB91 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.02■□□□□ 0.64
Med29Q9DB91 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC19.02■□□□□ 0.64
Med29Q9DB91 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.02■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC19.01■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.01■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Snx21-203ENSMUST00000152471 1243 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
Med29Q9DB91 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Hand2-201ENSMUST00000040104 2351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Agps-202ENSMUST00000111952 2589 ntTSL 2 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Gnpnat1-201ENSMUST00000046191 2788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Fam89b-203ENSMUST00000161368 1160 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
Med29Q9DB91 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.6 ms