Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAN9

Uncharacterized protein C17orf105 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 164 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Q9DAN9 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Jtb-201ENSMUST00000029546 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Q9DAN9 March9-201ENSMUST00000040307 3037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DAN9 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DAN9 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Ing1-201ENSMUST00000054399 2814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Mgrn1-201ENSMUST00000023159 3293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Q9DAN9 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Iars2-202ENSMUST00000110974 2431 ntTSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Hexdc-201ENSMUST00000038831 2378 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DAN9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DAN9 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAN9 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Dlg3-201ENSMUST00000000901 4885 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Q9DAN9 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Klc1-201ENSMUST00000084941 2504 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Q9DAN9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 18.4 ms