Protein–RNA interactions for Protein: Q9DAK3

Rhobtb1, Rho-related BTB domain-containing protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 695 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rhobtb1Q9DAK3 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.56■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 St7-207ENSMUST00000115418 1678 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Dapk1-202ENSMUST00000077453 5491 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.55■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Kif1bp-206ENSMUST00000162525 2311 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Slc37a3-211ENSMUST00000202749 434 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 A030005L19Rik-201ENSMUST00000220768 806 ntAPPRIS P1 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ctage5-211ENSMUST00000176322 2649 ntTSL 5 BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Capza2-201ENSMUST00000015877 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.54■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 B430218F22Rik-201ENSMUST00000181168 1495 ntAPPRIS P1 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.53■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.04
Rhobtb1Q9DAK3 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.52■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Gm20634-201ENSMUST00000090779 2956 ntBASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Mthfd2l-201ENSMUST00000071652 2159 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.51■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Nkx6-2-202ENSMUST00000106095 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Fam89b-201ENSMUST00000099955 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Prss50-201ENSMUST00000051097 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.5■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Kras-202ENSMUST00000111710 1194 ntTSL 5 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Gm22238-201ENSMUST00000175222 88 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 AC161180.2-201ENSMUST00000222567 1015 ntAPPRIS P1 BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.49■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Zfp768-202ENSMUST00000205266 2513 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Tusc3-202ENSMUST00000169034 1262 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Magi3-201ENSMUST00000064371 6640 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Rp2-203ENSMUST00000115391 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Sorcs2-202ENSMUST00000070720 2089 ntTSL 1 (best) BASIC21.48■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC21.47■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Gm44866-201ENSMUST00000208774 391 ntTSL 2 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Gm46212-201ENSMUST00000220256 1003 ntTSL 5 BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Ccnl2-201ENSMUST00000030944 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.46■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.03
Rhobtb1Q9DAK3 Klf1-201ENSMUST00000067060 1530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Bean1-205ENSMUST00000212979 2131 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Kcnc3-203ENSMUST00000207493 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.45■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Tmem185a-202ENSMUST00000114630 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.44■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 C1qtnf4-201ENSMUST00000111466 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Serp2-204ENSMUST00000228055 705 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Rhobtb1Q9DAK3 Spsb3-202ENSMUST00000068508 2004 ntTSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms