Protein–RNA interactions for Protein: Q9D842

Aplf, Aprataxin and PNK-like factor, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
AplfQ9D842 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC19■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC19■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC18.99■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC18.99■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC18.98■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Pxmp2-201ENSMUST00000031472 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Fam193a-202ENSMUST00000180376 5536 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.98■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.98■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Slc30a3-201ENSMUST00000031037 2089 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Nckap5los-201ENSMUST00000159738 1712 ntTSL 2 BASIC18.96■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
AplfQ9D842 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Agap2-202ENSMUST00000217941 5573 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC18.95■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.89■□□□□ 0.62
AplfQ9D842 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.89■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Fam91a1-201ENSMUST00000037270 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.88■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC18.88■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.87■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.87■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC18.86■□□□□ 0.61
AplfQ9D842 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.86■□□□□ 0.61
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms