Protein–RNA interactions for Protein: Q9D824

Fip1l1, Pre-mRNA 3'-end-processing factor FIP1, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 581 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Fip1l1Q9D824 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Kif27-203ENSMUST00000225388 5121 ntAPPRIS P1 BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Tm9sf3-201ENSMUST00000025989 6144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Nog-201ENSMUST00000061728 1695 ntAPPRIS P1 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Fads2-201ENSMUST00000025567 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Lgi2-202ENSMUST00000199942 6273 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Sox12-202ENSMUST00000182625 4453 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Rapgefl1-202ENSMUST00000107479 4855 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Gnas-222ENSMUST00000180362 1645 ntTSL 5 BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC20.58■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.89
Fip1l1Q9D824 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Cdk13-201ENSMUST00000042365 5202 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.58■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.57■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.56■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Rp9-201ENSMUST00000034763 1134 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC20.55■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.55■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 4930597O21Rik-201ENSMUST00000065878 984 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC20.54■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Nrxn2-205ENSMUST00000113462 6667 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Slc16a11-207ENSMUST00000136328 1403 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 A830010M20Rik-207ENSMUST00000162298 1408 ntTSL 5 BASIC20.53■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Maf-202ENSMUST00000109104 6360 ntAPPRIS P2 BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
Fip1l1Q9D824 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Gm2018-201ENSMUST00000140754 478 ntTSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Tsen34-201ENSMUST00000038521 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Hecw2-202ENSMUST00000097741 1132 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC20.49■□□□□ 0.87
Fip1l1Q9D824 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.2 ms