Protein–RNA interactions for Protein: Q9D7A6

Srp19, Signal recognition particle 19 kDa protein, mousemouse

Predictions only

Length 144 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Srp19Q9D7A6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 Runx2-207ENSMUST00000160673 1791 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.33
Srp19Q9D7A6 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.08■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Selenoo-201ENSMUST00000082439 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 P2ry2-202ENSMUST00000178340 2137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Tinagl1-202ENSMUST00000105998 1976 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Uba2-201ENSMUST00000102746 2579 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.07■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC17.06■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 K230010J24Rik-204ENSMUST00000187868 1810 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Rcor3-207ENSMUST00000192866 1844 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Fam89b-202ENSMUST00000116558 1189 ntTSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Lpar3-201ENSMUST00000039164 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC17.05■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Golph3-202ENSMUST00000226517 2359 ntBASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.04■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Scarb1-201ENSMUST00000086075 2521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Mapkap1-201ENSMUST00000113123 1530 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Endog-201ENSMUST00000015481 1063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.03■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Gsx2-201ENSMUST00000040477 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.32
Srp19Q9D7A6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.02■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Cers1-203ENSMUST00000165819 2728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Ptov1-201ENSMUST00000046575 1883 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.01■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Spsb3-204ENSMUST00000119829 1955 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC17■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Clasp2-211ENSMUST00000216817 2234 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Wnt10b-203ENSMUST00000226610 2217 ntAPPRIS P1 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Wnt10b-201ENSMUST00000023732 2226 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Gja3-201ENSMUST00000061614 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.99■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Ppp4c-211ENSMUST00000206570 1400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Zdhhc14-201ENSMUST00000089185 3115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.98■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Cnrip1-201ENSMUST00000058159 1654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.97■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Cnbp-208ENSMUST00000204653 2175 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Cnbp-201ENSMUST00000032138 2178 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Cdkl3-210ENSMUST00000121591 2387 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Bag5-201ENSMUST00000054636 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.31
Srp19Q9D7A6 Tmem106c-201ENSMUST00000064200 1635 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.96■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Fbxo24-201ENSMUST00000031732 2161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Eci1-201ENSMUST00000024946 1091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Tcte3-201ENSMUST00000040746 788 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Tcte3-202ENSMUST00000097398 632 ntTSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC16.95■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Zfp777-202ENSMUST00000114583 3111 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Trmt61a-202ENSMUST00000168338 2131 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Cenpb-201ENSMUST00000089510 4886 ntAPPRIS P1 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Snhg20-203ENSMUST00000182811 2153 ntBASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Ccdc85c-202ENSMUST00000222310 4298 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Gm19582-201ENSMUST00000187511 841 ntTSL 2 BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Srp19Q9D7A6 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.94■□□□□ 0.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 170.3 ms