Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4K7

Ccdc105, Coiled-coil domain-containing protein 105, mousemouse

Predictions only

Length 499 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc105Q9D4K7 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC23.73■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Fam92a-208ENSMUST00000177837 1325 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.72■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 AC161180.1-201ENSMUST00000223439 933 ntAPPRIS P1 BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Lin7b-201ENSMUST00000003971 735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Pitx2-202ENSMUST00000042587 2271 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.71■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.39
Ccdc105Q9D4K7 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 AW121686-201ENSMUST00000181049 2200 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Cadps-204ENSMUST00000177814 5461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Hif1a-203ENSMUST00000110464 1759 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.7■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.69■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Ihh-201ENSMUST00000164097 2468 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Gm20532-201ENSMUST00000174066 780 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Ndfip1-201ENSMUST00000025293 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Gfra4-206ENSMUST00000110240 1426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Zcchc2-202ENSMUST00000119166 6368 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Tm2d2-201ENSMUST00000033961 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
Ccdc105Q9D4K7 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Gas2l1-202ENSMUST00000056649 2847 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Ccdc105Q9D4K7 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.3 ms