Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4D2

4933402E13Rik, 4933402E13Rik protein, mousemouse

Predictions only

Length 429 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Ncoa5-202ENSMUST00000121377 2930 ntTSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Fzd8-201ENSMUST00000041080 3346 ntAPPRIS P1 BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Gjc2-202ENSMUST00000108793 2187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Kifc3-201ENSMUST00000034240 3277 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Pdzd3-201ENSMUST00000034618 2193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Sh3gl3-201ENSMUST00000032874 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Rasa1-201ENSMUST00000109552 4563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxo6-201ENSMUST00000030858 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnk15-202ENSMUST00000109396 1921 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 4930577N17Rik-201ENSMUST00000139771 1625 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Col23a1-201ENSMUST00000102765 5658 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 2310050C09Rik-201ENSMUST00000163439 1078 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
4933402E13RikQ9D4D2 Pkd2-201ENSMUST00000086831 5219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Gjc2-201ENSMUST00000108790 2169 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Iqsec1-210ENSMUST00000212100 3500 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Gnas-205ENSMUST00000109083 730 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Il17re-205ENSMUST00000203661 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Gm29430-202ENSMUST00000191453 2015 ntTSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 A530058N18Rik-203ENSMUST00000135729 1405 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 B230208H11Rik-201ENSMUST00000180529 1112 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Senp6-201ENSMUST00000037484 5111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43863-201ENSMUST00000203822 1192 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Ralgapa1-204ENSMUST00000219432 6631 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Hoxd3-201ENSMUST00000047830 2292 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Suz12-206ENSMUST00000163272 4303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Dedd-201ENSMUST00000064950 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Prrt1-201ENSMUST00000015620 1940 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Mgat1-213ENSMUST00000167400 3151 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Crlf3-203ENSMUST00000103233 2230 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Gm5112-201ENSMUST00000204407 2368 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Gm16286-205ENSMUST00000127234 1755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Olig1-201ENSMUST00000056882 2162 ntAPPRIS P1 BASIC24.52■■□□□ 1.52
4933402E13RikQ9D4D2 Cdk11b-202ENSMUST00000105598 2673 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Ets1-202ENSMUST00000050797 1976 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Siah2-201ENSMUST00000070368 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Ythdf1-201ENSMUST00000037299 3184 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Kcnj6-201ENSMUST00000095873 1773 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Rell2-202ENSMUST00000091932 1995 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 A530058N18Rik-204ENSMUST00000141209 709 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 B230322F03Rik-201ENSMUST00000181932 1569 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Tmem51-201ENSMUST00000036572 1875 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Mcmbp-202ENSMUST00000119081 2347 ntTSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Rasgrp2-206ENSMUST00000113472 2124 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Nars2-202ENSMUST00000107159 1777 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 1700016A09Rik-201ENSMUST00000192004 835 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Zbed3-201ENSMUST00000045909 1894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Arhgap23-202ENSMUST00000107601 5450 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Grin2c-202ENSMUST00000106554 4895 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Uap1-203ENSMUST00000111351 2287 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Uap1-201ENSMUST00000027981 2283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
4933402E13RikQ9D4D2 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Hs2st1-201ENSMUST00000043325 6177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Paip1-201ENSMUST00000026520 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Cers5-201ENSMUST00000023762 2096 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Ubxn2a-201ENSMUST00000020962 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Fam83d-201ENSMUST00000029183 2266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Klhl8-201ENSMUST00000031254 3193 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Pou2f2-205ENSMUST00000108417 1937 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
4933402E13RikQ9D4D2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC24.42■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38 ms