Protein–RNA interactions for Protein: Q9D4C6

Lrp2bp, LRP2-binding protein, mousemouse

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lrp2bpQ9D4C6 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gdf7-202ENSMUST00000220073 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.58■■□□□ 1.37
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.58■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Grin2d-203ENSMUST00000211713 5244 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.57■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC23.56■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.55■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Taf4-201ENSMUST00000041618 4416 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Nkx2-5-201ENSMUST00000015723 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.54■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Gm43566-201ENSMUST00000196851 808 ntBASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Tmem192-203ENSMUST00000209852 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Klhl2-205ENSMUST00000210166 5126 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.53■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Mapk15-201ENSMUST00000089669 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.52■■□□□ 1.36
Lrp2bpQ9D4C6 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.51■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.5■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Pou6f1-202ENSMUST00000073837 4953 ntTSL 1 (best) BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC23.49■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Nisch-201ENSMUST00000022469 5559 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC23.47■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Msl1-203ENSMUST00000107485 2091 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.35
Lrp2bpQ9D4C6 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Lrp2bpQ9D4C6 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 16.1 ms