Protein–RNA interactions for Protein: Q9D1X0

Nol3, Nucleolar protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 220 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Nol3Q9D1X0 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Sos2-206ENSMUST00000183277 4512 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Idh3a-205ENSMUST00000217484 2580 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Chst3-202ENSMUST00000135158 6108 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Gm12818-201ENSMUST00000117562 1349 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Arih1-207ENSMUST00000171975 6971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Mta3-204ENSMUST00000112352 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Tmem121b-201ENSMUST00000178687 4869 ntAPPRIS P1 BASIC18.48■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Gm26766-202ENSMUST00000227544 2347 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Gabbr1-201ENSMUST00000025338 5248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Asf1a-201ENSMUST00000020004 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 2310061I04Rik-202ENSMUST00000146451 2081 ntTSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Gm40983-202ENSMUST00000222598 1198 ntTSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Pde6d-201ENSMUST00000027444 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Usp36-202ENSMUST00000106296 5655 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.47■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Erc1-202ENSMUST00000079582 2304 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Fgfr1-215ENSMUST00000179592 5041 ntTSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Nin-203ENSMUST00000095666 7183 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Gapvd1-201ENSMUST00000028224 5695 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Hook1-202ENSMUST00000107083 1506 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Stambp-207ENSMUST00000206592 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Serpinb6a-206ENSMUST00000167163 1654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Tmem55b-201ENSMUST00000049312 1594 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC18.46■□□□□ 0.55
Nol3Q9D1X0 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Nexmif-201ENSMUST00000056502 5211 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Slc39a13-203ENSMUST00000111436 1291 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Slc2a13-202ENSMUST00000109283 6536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.45■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Ago4-201ENSMUST00000084289 6537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Hibadh-201ENSMUST00000031788 1825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Itsn2-215ENSMUST00000220311 6080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Atrnl1-201ENSMUST00000077282 6581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Tmem70-203ENSMUST00000177501 1636 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Ppp1r35-201ENSMUST00000031739 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Pim3-201ENSMUST00000042818 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Ntn1-202ENSMUST00000108674 5874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Nt5c3-201ENSMUST00000031793 1676 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Slc35f5-201ENSMUST00000027580 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Lrrc58-201ENSMUST00000078717 8604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Znhit6-201ENSMUST00000098534 2339 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Dennd6a-201ENSMUST00000037585 6638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Usp36-201ENSMUST00000092382 5609 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 A530095I07Rik-201ENSMUST00000070942 847 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Slc30a9-201ENSMUST00000113676 5648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Dusp22-201ENSMUST00000091672 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
Nol3Q9D1X0 Cdk19-201ENSMUST00000044672 5807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Gm9910-201ENSMUST00000195385 1550 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 A230005M16Rik-201ENSMUST00000137661 1605 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Panx1-202ENSMUST00000164273 5732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Nol3Q9D1X0 Crebbp-201ENSMUST00000023165 10820 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 63 ms