Protein–RNA interactions for Protein: Q9D0Z3

Tmem53, Transmembrane protein 53, mousemouse

Predictions only

Length 276 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Tmem53Q9D0Z3 Dgcr6-207ENSMUST00000151266 1086 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Gm12905-201ENSMUST00000153814 658 ntTSL 2 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Nsd1-203ENSMUST00000224156 1149 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Coprs-201ENSMUST00000033839 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Srcap-210ENSMUST00000188124 2048 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Snx7-201ENSMUST00000029639 2021 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Slc16a11-211ENSMUST00000171032 1754 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Tmx4-202ENSMUST00000110119 596 ntTSL 2 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Sin3b-202ENSMUST00000109950 1024 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.83
Tmem53Q9D0Z3 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Bpifb4-202ENSMUST00000109757 2420 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Ak2-201ENSMUST00000030583 986 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC20.2■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Kctd2-202ENSMUST00000106533 2649 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Faim-202ENSMUST00000112911 803 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Cnot6-201ENSMUST00000020624 2498 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Baiap2-203ENSMUST00000103021 3398 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Fn1-208ENSMUST00000186940 1350 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Hgh1-201ENSMUST00000023213 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Ccdc142-201ENSMUST00000101254 2317 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Gm43006-201ENSMUST00000197702 1602 ntBASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Mras-201ENSMUST00000035045 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Tmem53Q9D0Z3 Fbxw4-201ENSMUST00000046869 2068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Cbln2-203ENSMUST00000122464 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gng12-203ENSMUST00000114224 680 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gng12-206ENSMUST00000114227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Phf14-202ENSMUST00000115510 3353 ntTSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Prdm13-201ENSMUST00000076206 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Tmem53Q9D0Z3 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.12■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 11.4 ms