Protein–RNA interactions for Protein: Q9CY57

Chtop, Chromatin target of PRMT1 protein, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 249 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ChtopQ9CY57 Gpr160-202ENSMUST00000108258 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Mylip-201ENSMUST00000038275 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 AC154231.1-201ENSMUST00000220564 2175 ntBASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.24■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Pkm-201ENSMUST00000034834 2432 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Dnajb2-202ENSMUST00000082158 1253 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Nkain2-201ENSMUST00000092602 558 ntBASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Gm11549-201ENSMUST00000124606 2829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Siah1a-201ENSMUST00000045296 1968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Rab1a-203ENSMUST00000109602 2626 ntTSL 5 BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.23■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Chd5-205ENSMUST00000164662 9375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.22■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Lrp8-204ENSMUST00000106733 3332 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Klf15-201ENSMUST00000032174 2373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Phlda3-201ENSMUST00000038945 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.21■□□□□ 0.19
ChtopQ9CY57 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.2■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Timm50-201ENSMUST00000081946 1515 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 1700069B07Rik-202ENSMUST00000191155 939 ntBASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Cnep1r1-201ENSMUST00000095214 1731 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC16.19■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Dapk2-201ENSMUST00000034944 1772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Raph1-201ENSMUST00000027168 2241 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Nnat-208ENSMUST00000173595 927 ntTSL 2 BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Ift57-201ENSMUST00000046777 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Smad2-205ENSMUST00000168423 2857 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.18■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Cdc16-201ENSMUST00000043962 2301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Tsen34-211ENSMUST00000205287 1375 ntTSL 5 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Tmie-201ENSMUST00000050958 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Bod1-202ENSMUST00000109415 799 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Mxd4-202ENSMUST00000119171 1160 ntTSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Eid1-201ENSMUST00000164756 1691 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Hist2h3c1-201ENSMUST00000176059 1820 ntAPPRIS P1 BASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Hist2h3c1-202ENSMUST00000177796 1825 ntBASIC16.17■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Azin2-202ENSMUST00000106068 2049 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Ppp4c-201ENSMUST00000032936 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Zfp523-201ENSMUST00000002318 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Cav2-201ENSMUST00000000058 2733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Ankrd49-205ENSMUST00000216037 1037 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Mxra7-202ENSMUST00000047715 757 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Med25-201ENSMUST00000003049 2619 ntTSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.16■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Mark2-207ENSMUST00000165286 2975 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Nlgn2-201ENSMUST00000056484 5003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 6430628N08Rik-202ENSMUST00000165938 1602 ntTSL 5 BASIC16.15■□□□□ 0.18
ChtopQ9CY57 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC16.15■□□□□ 0.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 38.3 ms