Protein–RNA interactions for Protein: Q9CSV6

Sft2d3, Vesicle transport protein SFT2C, mousemouse

Predictions only

Length 209 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sft2d3Q9CSV6 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.04■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Brsk1-201ENSMUST00000048248 2996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.03■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.48
Sft2d3Q9CSV6 Xbp1-201ENSMUST00000063084 2129 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.02■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Zfp346-203ENSMUST00000159278 1253 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Gng3-201ENSMUST00000096259 1699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Adgrb1-202ENSMUST00000170845 2704 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Gm15820-201ENSMUST00000201566 728 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.98■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Srsf12-201ENSMUST00000067864 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Cpeb3-205ENSMUST00000126781 2095 ntTSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.97■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Emid1-208ENSMUST00000163299 1923 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Wtap-203ENSMUST00000159551 2060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Tlk2-202ENSMUST00000092537 2743 ntTSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.96■□□□□ 0.47
Sft2d3Q9CSV6 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.95■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Gm28040-202ENSMUST00000184603 890 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 AC164424.2-201ENSMUST00000223281 725 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Sft2d3Q9CSV6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 105.1 ms