Protein–RNA interactions for Protein: Q9CQ20

Mid1ip1, Mid1-interacting protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 182 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mid1ip1Q9CQ20 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Tmbim4-204ENSMUST00000134797 486 ntTSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Map4k3-202ENSMUST00000112389 4231 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.35■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Ewsr1-205ENSMUST00000102930 2174 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.34■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.53
Mid1ip1Q9CQ20 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.33■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.32■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Myo1b-202ENSMUST00000046390 5052 ntTSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Arhgap9-204ENSMUST00000219511 2217 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.31■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.3■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Dbp-204ENSMUST00000211513 1156 ntTSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Hp1bp3-205ENSMUST00000105827 5155 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.29■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.28■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Gm13256-201ENSMUST00000131297 520 ntTSL 3 BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.52
Mid1ip1Q9CQ20 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.27■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Magi2-206ENSMUST00000197443 6578 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.26■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.25■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Neo1-202ENSMUST00000214547 5414 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.24■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.23■□□□□ 0.51
Mid1ip1Q9CQ20 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.22■□□□□ 0.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.7 ms