Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPW0

Cntnap2, Contactin-associated protein-like 2, mousemouse

Predictions only

Length 1,332 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Cntnap2Q9CPW0 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Atp6v1f-201ENSMUST00000004396 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Gm13241-201ENSMUST00000094493 780 ntBASIC24.03■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Nkain1-201ENSMUST00000105993 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC24.02■■□□□ 1.44
Cntnap2Q9CPW0 Pawr-202ENSMUST00000218332 870 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.01■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.99■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.98■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.97■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Morn4-201ENSMUST00000051772 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.96■■□□□ 1.43
Cntnap2Q9CPW0 Gprc5b-204ENSMUST00000208394 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.95■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Fam220a-204ENSMUST00000119488 2202 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Fam220a-209ENSMUST00000200267 2202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Mnx1-202ENSMUST00000165512 2245 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC23.94■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.93■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Cep68-202ENSMUST00000109596 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.92■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 P4htm-201ENSMUST00000006853 1841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.91■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.9■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.89■■□□□ 1.42
Cntnap2Q9CPW0 P2rx2-202ENSMUST00000112478 1632 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.89■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.88■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Irf2bp2-201ENSMUST00000054960 5080 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Brwd1-203ENSMUST00000113827 2382 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Mapk1-201ENSMUST00000023462 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Zfp513-201ENSMUST00000031562 2213 ntTSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.87■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.86■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Sdccag3-203ENSMUST00000114100 2099 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.85■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.84■■□□□ 1.41
Cntnap2Q9CPW0 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.84■■□□□ 1.41
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 55.2 ms