Protein–RNA interactions for Protein: Q9CPR6

Krt88, Keratin 88, mousemouse

Predictions only

Length 171 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Krt88Q9CPR6 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Notum-203ENSMUST00000106178 2012 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC19.17■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Ube2e2-205ENSMUST00000150727 1523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Gm8503-201ENSMUST00000118131 455 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Npr3-205ENSMUST00000228603 2437 ntAPPRIS ALT2 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC19.16■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Inafm1-201ENSMUST00000169612 1605 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Atp10a-201ENSMUST00000168747 5419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Zfp598-201ENSMUST00000047179 3286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Anapc11-202ENSMUST00000093140 962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.15■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.66
Krt88Q9CPR6 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Naa20-201ENSMUST00000002805 1172 ntTSL 1 (best) BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC19.14■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Mmp24-201ENSMUST00000029141 4306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Cntfr-203ENSMUST00000102961 1995 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Phf12-202ENSMUST00000108360 3047 ntTSL 1 (best) BASIC19.13■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Znrf1-204ENSMUST00000171182 5466 ntTSL 3 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Stx3-202ENSMUST00000069285 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Mgat5b-201ENSMUST00000103027 4258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Hsf1-207ENSMUST00000228371 2102 ntBASIC19.12■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.11■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Slc22a23-201ENSMUST00000040336 6251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Hunk-201ENSMUST00000065856 5009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Tmem64-201ENSMUST00000062684 4670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Atmin-201ENSMUST00000109099 4877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Notumos-201ENSMUST00000151998 2659 ntBASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Kdm3b-201ENSMUST00000043775 6363 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Gab1-201ENSMUST00000034150 4870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
Krt88Q9CPR6 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Ube4b-202ENSMUST00000103212 5626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Ezh2-201ENSMUST00000081721 2787 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Sema6d-202ENSMUST00000076335 6276 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Nrxn2-201ENSMUST00000077182 6059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Chadl-201ENSMUST00000072910 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Kansl1-205ENSMUST00000106977 5510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Zfyve21-201ENSMUST00000021714 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Hipk1-201ENSMUST00000029438 4185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC19.03■□□□□ 0.64
Krt88Q9CPR6 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.03■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14.8 ms