Protein–RNA interactions for Protein: Q99M80

Ptprt, Receptor-type tyrosine-protein phosphatase T, mousemouse

Predictions only

Length 1,454 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PtprtQ99M80 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.67■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Hoxa9-202ENSMUST00000114425 851 ntTSL 2 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.66■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Wnt16-203ENSMUST00000148639 1168 ntTSL 1 (best) BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.65■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Gm36210-201ENSMUST00000210663 1279 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 AC153504.1-201ENSMUST00000218379 2290 ntBASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.64■■■□□ 2.98
PtprtQ99M80 Fbxl21-202ENSMUST00000121095 798 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC33.63■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Kif1c-205ENSMUST00000152618 1943 ntTSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Mpig6b-202ENSMUST00000174190 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC33.62■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Wrap73-201ENSMUST00000030895 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.61■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Gm12669-201ENSMUST00000122162 1009 ntBASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Gsk3a-202ENSMUST00000108411 2248 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.6■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC33.59■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Emid1-201ENSMUST00000062821 1947 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC33.58■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Rbp4-202ENSMUST00000112335 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC33.57■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Spcs1-204ENSMUST00000226782 949 ntBASIC33.57■■■□□ 2.97
PtprtQ99M80 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC33.57■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 AC133650.2-201ENSMUST00000217036 607 ntTSL 3 BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.56■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Rasgef1c-203ENSMUST00000093142 2216 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.55■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Gm8493-201ENSMUST00000196881 489 ntBASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.54■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.53■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.53■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Gm20163-202ENSMUST00000212288 989 ntTSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Ankrd9-204ENSMUST00000140788 1451 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.52■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Gm9780-201ENSMUST00000184272 350 ntTSL 2 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.51■■■□□ 2.96
PtprtQ99M80 Mpz-202ENSMUST00000111334 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC33.5■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 5031425E22Rik-201ENSMUST00000101522 2110 ntBASIC33.49■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 A930018P22Rik-201ENSMUST00000040374 822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.49■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Cadm1-209ENSMUST00000152459 1784 ntTSL 1 (best) BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Gm44965-201ENSMUST00000204121 360 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC33.48■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.47■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Cpe-201ENSMUST00000048967 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.46■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Gssos2-201ENSMUST00000130859 727 ntTSL 3 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC33.45■■■□□ 2.95
PtprtQ99M80 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC33.44■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Arrb2-203ENSMUST00000102563 1352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
PtprtQ99M80 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.43■■■□□ 2.94
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.6 ms