Protein–RNA interactions for Protein: Q99KN2

Ciao1, Probable cytosolic iron-sulfur protein assembly protein CIAO1, mousemouse

Predictions only

Length 339 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ciao1Q99KN2 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC26■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Pwwp2b-202ENSMUST00000172136 2543 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Fam120a-201ENSMUST00000060805 5105 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC25.99■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Ildr2-203ENSMUST00000192638 2587 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.99■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC25.98■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Osbpl10-207ENSMUST00000183104 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.98■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.97■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC25.96■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 March2-210ENSMUST00000186022 2470 ntTSL 1 (best) BASIC25.96■■□□□ 1.75
Ciao1Q99KN2 Antxr1-204ENSMUST00000204805 2156 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.95■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Pax1-201ENSMUST00000109968 2643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.94■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Efna3-201ENSMUST00000029673 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.93■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC25.92■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.92■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.91■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Elf2-204ENSMUST00000108053 2611 ntTSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.9■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC25.9■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC25.89■■□□□ 1.74
Ciao1Q99KN2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.89■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.88■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.88■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC25.87■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.87■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC25.86■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Ncoa7-206ENSMUST00000215725 1445 ntTSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.86■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Gm10685-201ENSMUST00000196120 433 ntTSL 3 BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.85■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Hoxd3os1-204ENSMUST00000156342 796 ntTSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Map1lc3a-201ENSMUST00000029128 1112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Ptms-201ENSMUST00000032216 1149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Xpa-202ENSMUST00000058232 1241 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.84■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Sucla2-201ENSMUST00000022706 1545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Gnaq-201ENSMUST00000025541 5644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Homer2-201ENSMUST00000026922 1736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Gm11837-201ENSMUST00000136992 876 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Ciao1Q99KN2 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.83■■□□□ 1.73
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 14 ms