Protein–RNA interactions for Protein: Q91ZP4

Slc5a4b, MCG3105, isoform CRA_a, mousemouse

Predictions only

Length 660 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc5a4bQ91ZP4 Sohlh1-201ENSMUST00000076989 1289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC29■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Acvr2b-202ENSMUST00000165044 2093 ntTSL 2 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Krtap5-3-201ENSMUST00000084414 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Fam220a-201ENSMUST00000067145 2198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.99■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Hsd17b3-202ENSMUST00000166224 1286 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Gm37179-201ENSMUST00000194862 823 ntBASIC28.98■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Cdc14b-207ENSMUST00000221634 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.98■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13067-201ENSMUST00000134236 404 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Bax-205ENSMUST00000211365 801 ntTSL 3 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Ints11-202ENSMUST00000120794 1884 ntTSL 5 BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Nabp2-202ENSMUST00000164199 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.97■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6916-201ENSMUST00000205277 828 ntTSL 3 BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Fuz-214ENSMUST00000209132 853 ntTSL 1 (best) BASIC28.96■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 St3gal5-201ENSMUST00000069994 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.23
Slc5a4bQ91ZP4 Taf3-203ENSMUST00000114907 695 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Cacna2d1-207ENSMUST00000196750 1272 ntTSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.95■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Rhbdl1-201ENSMUST00000026831 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Slc44a1-203ENSMUST00000107646 1974 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Rpusd3-204ENSMUST00000129047 1045 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Yjefn3-203ENSMUST00000180068 629 ntTSL 5 BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Rpusd3-201ENSMUST00000060634 1224 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Ildr2-205ENSMUST00000193860 2320 ntTSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Nrsn1-201ENSMUST00000057866 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.94■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Usf2-211ENSMUST00000172417 648 ntTSL 5 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Wdr70-203ENSMUST00000227371 1130 ntBASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Chrac1-201ENSMUST00000089765 871 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Nrg3-202ENSMUST00000168810 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC28.93■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm38287-201ENSMUST00000195193 2051 ntTSL 3 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Prr3-204ENSMUST00000172900 439 ntTSL 2 BASIC28.92■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Mrpl52-201ENSMUST00000010550 418 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Ninj1-201ENSMUST00000049022 1187 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.91■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Clk2-203ENSMUST00000121931 2112 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm8773-201ENSMUST00000101627 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Sap30-201ENSMUST00000034022 1178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Acot5-202ENSMUST00000072505 1401 ntTSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10493-201ENSMUST00000097270 612 ntBASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.9■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Gm13001-201ENSMUST00000154285 774 ntTSL 2 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 1700012B09Rik-204ENSMUST00000191047 654 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC28.89■■■□□ 2.22
Slc5a4bQ91ZP4 Efna2-201ENSMUST00000003154 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Serbp1-212ENSMUST00000204294 717 ntTSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Micu3-201ENSMUST00000068999 2219 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.88■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Sugct-201ENSMUST00000068545 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Neurl1b-203ENSMUST00000183077 1084 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Mob2-205ENSMUST00000211000 1646 ntTSL 5 BASIC28.87■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Arhgap8-207ENSMUST00000172307 1544 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Fam149b-203ENSMUST00000090499 2370 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Fam168b-208ENSMUST00000191307 844 ntTSL 2 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Gm42642-201ENSMUST00000200683 355 ntBASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Krtap5-4-201ENSMUST00000061403 1046 ntAPPRIS P1 BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Bend7-202ENSMUST00000115022 1945 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.86■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Gm10849-201ENSMUST00000100397 618 ntBASIC28.85■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Gltpd2-201ENSMUST00000057685 1216 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Hyi-201ENSMUST00000006562 910 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Nat14-204ENSMUST00000207687 1415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.85■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Kazald1-201ENSMUST00000026234 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC28.84■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Srp19-202ENSMUST00000119329 613 ntTSL 2 BASIC28.83■■■□□ 2.21
Slc5a4bQ91ZP4 Gon7-201ENSMUST00000173969 1152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Gar1-201ENSMUST00000029643 1271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.82■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Dusp28-201ENSMUST00000060913 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Tarbp2-202ENSMUST00000100168 1278 ntTSL 1 (best) BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Cox16-207ENSMUST00000169124 685 ntTSL 2 BASIC28.81■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Thra-202ENSMUST00000103139 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Snx16-203ENSMUST00000195822 1084 ntTSL 1 (best) BASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm9870-201ENSMUST00000063874 645 ntBASIC28.8■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Aktip-201ENSMUST00000109609 1171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm6569-201ENSMUST00000154520 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm15867-201ENSMUST00000159407 388 ntTSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Slc25a41-201ENSMUST00000058661 1225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC28.79■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm960-202ENSMUST00000177696 2262 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Bag1-202ENSMUST00000108089 1336 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Tcte2-209ENSMUST00000143162 1221 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Gm43173-201ENSMUST00000202246 593 ntBASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 AC158777.2-201ENSMUST00000228787 398 ntAPPRIS P1 BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Acbd6-202ENSMUST00000080138 993 ntTSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Slc5a4bQ91ZP4 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC28.78■■■□□ 2.2
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25 ms