Protein–RNA interactions for Protein: Q91Z38

Ttc1, Tetratricopeptide repeat protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttc1Q91Z38 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.9■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
Ttc1Q91Z38 Fam168b-204ENSMUST00000170092 941 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Ubtf-210ENSMUST00000174302 4692 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.89■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Dynll1-202ENSMUST00000112090 729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Ppp4r2-201ENSMUST00000063854 4874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Gm27040-201ENSMUST00000181984 504 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Spire2-201ENSMUST00000010298 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Tlx2-202ENSMUST00000174674 1514 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Tmem240-202ENSMUST00000147721 817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 AC116713.1-201ENSMUST00000215074 430 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Whrn-202ENSMUST00000063672 2804 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Mettl24-201ENSMUST00000058747 1529 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Mtm1-204ENSMUST00000101501 770 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Yy1-201ENSMUST00000021692 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Kcnj12-202ENSMUST00000089184 2291 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
Ttc1Q91Z38 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 1700065D16Rik-202ENSMUST00000188975 506 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Best2-202ENSMUST00000209322 1944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Begain-203ENSMUST00000190647 2707 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Krtap28-10-201ENSMUST00000188323 957 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Dynll1-201ENSMUST00000009157 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Drd4-201ENSMUST00000026569 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Ankrd13c-202ENSMUST00000164582 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Frmd4a-201ENSMUST00000075767 6761 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Tmem42-201ENSMUST00000084733 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Tmem230-202ENSMUST00000110163 1551 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Fam118b-201ENSMUST00000059057 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Gnl1-201ENSMUST00000087200 2848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Pou3f3-201ENSMUST00000054883 7409 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Ergic1-206ENSMUST00000167662 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Eif5a-208ENSMUST00000108611 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Gm5602-201ENSMUST00000146366 1763 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Gm7544-201ENSMUST00000222426 828 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Otud5-204ENSMUST00000115667 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Ttc1Q91Z38 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Pgls-201ENSMUST00000034264 893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Ttc1Q91Z38 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 34.2 ms