Protein–RNA interactions for Protein: Q91YK2

Rrp1b, Ribosomal RNA processing protein 1 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 724 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Rrp1bQ91YK2 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Gm26917-201ENSMUST00000182520 869 ntTSL 5 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Cib1-201ENSMUST00000065163 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Tceal5-201ENSMUST00000066819 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Nckap1-201ENSMUST00000028386 4469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Abhd12-201ENSMUST00000056149 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Slbp-201ENSMUST00000057551 1906 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.6■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Gm26660-201ENSMUST00000181582 2543 ntTSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.59■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Galnt11-201ENSMUST00000045737 2552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Pi4kb-207ENSMUST00000167008 1962 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Rab43-202ENSMUST00000032135 1262 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.21
Rrp1bQ91YK2 Rgs6-202ENSMUST00000161801 2141 ntTSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Slc35a2-201ENSMUST00000096514 1757 ntTSL 5 BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.58■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Gm28513-201ENSMUST00000191474 613 ntTSL 3 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Gm45364-201ENSMUST00000210883 159 ntBASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Slc27a3-201ENSMUST00000029541 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Hras-201ENSMUST00000026572 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Rora-202ENSMUST00000113624 2591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Rell2-210ENSMUST00000176104 2150 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.55■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Fance-204ENSMUST00000114804 1842 ntTSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Ube2d2a-202ENSMUST00000170693 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 1110065P20Rik-201ENSMUST00000106190 968 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Gm6821-201ENSMUST00000107540 542 ntBASIC22.54■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Hccs-202ENSMUST00000112115 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Ppp1ca-201ENSMUST00000046094 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Grsf1-201ENSMUST00000078945 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Fus-204ENSMUST00000121616 1102 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 AY074887-201ENSMUST00000054018 769 ntAPPRIS P1 BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 3110053B16Rik-202ENSMUST00000140360 2004 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Lsm14a-201ENSMUST00000085585 2944 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Shox2-201ENSMUST00000029422 3079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
Rrp1bQ91YK2 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Gm34220-201ENSMUST00000223001 2709 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Izumo4-205ENSMUST00000218184 1196 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Akt1-201ENSMUST00000001780 2690 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Stat5b-201ENSMUST00000004143 5062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 H2afj-201ENSMUST00000074556 1831 ntAPPRIS P2 BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Hoxd13-201ENSMUST00000001872 2483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Ldb1-202ENSMUST00000056931 2295 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Gimap1-201ENSMUST00000054368 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Gm4430-201ENSMUST00000192413 1943 ntBASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Adad2-201ENSMUST00000098361 1926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Bcl7c-207ENSMUST00000207019 654 ntTSL 3 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Gsr-201ENSMUST00000033992 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Desi2-204ENSMUST00000161075 2590 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Prdm11-205ENSMUST00000178666 1870 ntTSL 5 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Guk1-204ENSMUST00000170202 1078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Ltk-202ENSMUST00000082130 2767 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Gm15893-201ENSMUST00000143208 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Tceal3-201ENSMUST00000060904 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Txnl4a-204ENSMUST00000145963 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Gm10125-201ENSMUST00000074702 2286 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Fastk-201ENSMUST00000030800 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.19
Rrp1bQ91YK2 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Ipp-202ENSMUST00000106479 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Ipp-201ENSMUST00000030461 2115 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 D16Ertd472e-201ENSMUST00000114218 1271 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 4930542C12Rik-201ENSMUST00000171096 1203 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Ppp6r2-202ENSMUST00000226221 2559 ntBASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 C2cd4b-201ENSMUST00000171652 1327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Rrp1bQ91YK2 Gm9888-201ENSMUST00000150678 965 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 27.8 ms