Protein–RNA interactions for Protein: Q91YE8

Synpo2, Synaptopodin-2, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 1,087 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Synpo2Q91YE8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Tmem55b-209ENSMUST00000162957 1465 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Gm6217-201ENSMUST00000222182 829 ntAPPRIS P1 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Trim9-208ENSMUST00000221370 2393 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Frmd5-201ENSMUST00000110592 2222 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Flot2-201ENSMUST00000072289 2621 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.77■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Synpo2Q91YE8 Dmtn-209ENSMUST00000228295 2572 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Mfsd4b2-201ENSMUST00000045526 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Ptbp3-208ENSMUST00000172768 2147 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Irf5-201ENSMUST00000004392 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Efcc1-201ENSMUST00000032132 2729 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Gm29735-201ENSMUST00000209599 660 ntAPPRIS P1 BASIC22.74■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Phox2b-201ENSMUST00000012664 3013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Hras-202ENSMUST00000097957 1199 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Spata5l1-202ENSMUST00000152813 1526 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Srsf2-201ENSMUST00000092404 1899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Zfp523-202ENSMUST00000073534 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Fip1l1-202ENSMUST00000113534 2140 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 G630030J09Rik-201ENSMUST00000181958 2135 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Synpo2Q91YE8 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 H2afj-202ENSMUST00000203982 577 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Nt5m-201ENSMUST00000102695 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Mtf2-202ENSMUST00000112626 1968 ntTSL 5 BASIC22.7■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Mal2-201ENSMUST00000025356 2950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Gm16286-201ENSMUST00000025463 1650 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Zcchc2-201ENSMUST00000118196 5796 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Klhdc10-202ENSMUST00000068259 5901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
Synpo2Q91YE8 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 33.8 ms