Protein–RNA interactions for Protein: Q8VDU3

Apol9a, Apol9a protein, mousemouse

Predictions only

Length 310 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Apol9aQ8VDU3 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Ffar4-201ENSMUST00000067098 1393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Dnajc19-203ENSMUST00000117223 1695 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Rsrc1-202ENSMUST00000065047 2736 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 1810026B05Rik-203ENSMUST00000184587 5738 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Vstm4-201ENSMUST00000053175 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Unc119-203ENSMUST00000108295 1371 ntTSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Ttc39c-201ENSMUST00000025294 2571 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Sike1-202ENSMUST00000119450 774 ntTSL 3 BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Clpp-201ENSMUST00000002735 1207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.15
Apol9aQ8VDU3 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Rnaseh2c-201ENSMUST00000025864 1126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Barhl1-202ENSMUST00000113847 2160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Arl5a-201ENSMUST00000036541 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Lhx2-201ENSMUST00000000253 2840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Rnf166-201ENSMUST00000014614 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Cnot6-203ENSMUST00000145353 5736 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Cnnm1-202ENSMUST00000223787 2931 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Ptpre-202ENSMUST00000209256 2593 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Eva1b-202ENSMUST00000106150 1144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Raver2-202ENSMUST00000106955 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Hnrnpul1-202ENSMUST00000108401 1240 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Pigv-202ENSMUST00000067902 990 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 Gfi1-202ENSMUST00000065478 2639 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.14
Apol9aQ8VDU3 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Galr3-201ENSMUST00000058004 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Oser1-201ENSMUST00000046908 1620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Rab3ip-203ENSMUST00000219109 1844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Gm43403-201ENSMUST00000198011 1786 ntBASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Slc30a1-201ENSMUST00000044954 5244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Ttc14-211ENSMUST00000200271 2724 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Ugp2-201ENSMUST00000060895 2044 ntTSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Gm16049-201ENSMUST00000155166 616 ntTSL 3 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Vegfa-212ENSMUST00000214739 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Btg3-201ENSMUST00000023570 1414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.12■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Irf2bp1-201ENSMUST00000053713 2734 ntAPPRIS P1 BASIC22.11■■□□□ 1.13
Apol9aQ8VDU3 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.6 ms