Protein–RNA interactions for Protein: Q8VBW5

Bbx, HMG box transcription factor BBX, mousemouse

Predictions only

Length 907 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BbxQ8VBW5 Trappc6b-207ENSMUST00000218686 785 ntTSL 3 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 A030014E15Rik-201ENSMUST00000223400 796 ntAPPRIS P1 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Atn1-201ENSMUST00000088357 4433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Notum-202ENSMUST00000106177 2212 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Dhrs13-201ENSMUST00000021187 1779 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 BC037034-205ENSMUST00000159649 2093 ntTSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC23.16■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Nab1-201ENSMUST00000069792 3874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Gm26711-201ENSMUST00000180866 1833 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Cebpa-202ENSMUST00000205391 2161 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Zbtb10-201ENSMUST00000155203 7414 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Eml2-202ENSMUST00000117338 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
BbxQ8VBW5 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Atxn7-203ENSMUST00000223880 2946 ntAPPRIS P2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 H2afy-201ENSMUST00000016081 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Smc6-201ENSMUST00000020931 5603 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.13■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Gm10125-205ENSMUST00000161921 1463 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Kif1bp-202ENSMUST00000159704 2622 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC23.12■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Adat3-204ENSMUST00000038411 1411 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.12■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Tmem170b-202ENSMUST00000221694 602 ntTSL 3 BASIC23.11■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.11■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Rap1a-201ENSMUST00000090678 2407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Gm38160-201ENSMUST00000193090 2499 ntBASIC23.1■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.1■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Srsf10-203ENSMUST00000102544 2225 ntTSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Cbx4-201ENSMUST00000026665 5179 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.09■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC23.09■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Rab4a-202ENSMUST00000118535 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC23.08■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 March2-206ENSMUST00000173329 2566 ntTSL 2 BASIC23.08■■□□□ 1.29
BbxQ8VBW5 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Ipmk-202ENSMUST00000118381 1323 ntTSL 1 (best) BASIC23.08■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Trnau1ap-203ENSMUST00000105962 961 ntTSL 5 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Cers1-202ENSMUST00000140239 2711 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 AC164550.2-201ENSMUST00000219127 2086 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Rpl35-201ENSMUST00000080861 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Mknk2-205ENSMUST00000200082 3439 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Mageb3-201ENSMUST00000104936 2341 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Dmrt3-201ENSMUST00000048935 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Lsm4-205ENSMUST00000210987 636 ntTSL 5 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Gm7276-201ENSMUST00000097520 1252 ntAPPRIS P1 BASIC23.05■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Nudc-201ENSMUST00000030665 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
BbxQ8VBW5 Ppm1g-205ENSMUST00000202294 1868 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 82.9 ms