Protein–RNA interactions for Protein: Q8K4L4

Pof1b, Protein POF1B, mousemouse

Predictions only

Length 587 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pof1bQ8K4L4 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pof1bQ8K4L4 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
Pof1bQ8K4L4 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
Pof1bQ8K4L4 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pof1bQ8K4L4 Foxe3-201ENSMUST00000050940 867 ntAPPRIS P1 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pof1bQ8K4L4 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
Pof1bQ8K4L4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC25.45■■□□□ 1.67
Pof1bQ8K4L4 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Vax1-201ENSMUST00000172821 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Gm28417-202ENSMUST00000185881 538 ntTSL 3 BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Trim27-207ENSMUST00000223065 2046 ntTSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC25.43■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.43■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Gm32051-202ENSMUST00000197905 2385 ntBASIC25.42■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Grap-201ENSMUST00000004959 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC25.42■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Fam189a2-201ENSMUST00000096164 2547 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Picalm-205ENSMUST00000207225 3489 ntTSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Pde6d-203ENSMUST00000146220 879 ntTSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Gm45444-201ENSMUST00000211394 898 ntBASIC25.41■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Lsm4-201ENSMUST00000034311 925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 4930444P10Rik-202ENSMUST00000145070 1844 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.41■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Gm13429-202ENSMUST00000128242 692 ntTSL 3 BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Ccdc92-201ENSMUST00000036206 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.4■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Sox17-202ENSMUST00000116652 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC25.39■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Dhrs11-201ENSMUST00000047560 1254 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.66
Pof1bQ8K4L4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC25.39■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Ntn5-203ENSMUST00000183120 1491 ntTSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.38■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC25.37■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Cbln2-204ENSMUST00000169470 2201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.37■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Usp48-205ENSMUST00000105840 5741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 March5-202ENSMUST00000112391 1293 ntTSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC25.36■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.36■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Cckbr-202ENSMUST00000181339 1326 ntTSL 1 (best) BASIC25.35■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Gm13042-201ENSMUST00000119244 1955 ntBASIC25.35■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC25.34■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.34■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.65
Pof1bQ8K4L4 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Pus1-202ENSMUST00000031483 1814 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.33■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Gm20684-201ENSMUST00000176744 380 ntTSL 3 BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.32■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Ppp1cb-206ENSMUST00000202078 383 ntTSL 5 BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.31■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Txn2-204ENSMUST00000109748 2049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Smarcc1-201ENSMUST00000088716 5717 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.3■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Ears2-201ENSMUST00000033159 2046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Taf4-204ENSMUST00000227325 4380 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Hagh-201ENSMUST00000024974 1101 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Pof1bQ8K4L4 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.29■■□□□ 1.64
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 154 ms