Protein–RNA interactions for Protein: Q8CHZ9

Mterf1a, Transcription termination factor 1a, mitochondrial, mousemouse

Predictions only

Length 379 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Mterf1aQ8CHZ9 Irx5-202ENSMUST00000210246 2550 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp3-201ENSMUST00000060444 2061 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC20.24■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC20.23■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Pdp1-204ENSMUST00000108299 2588 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Pth1r-201ENSMUST00000006005 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.23■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Prrx2-201ENSMUST00000041659 1441 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Chsy1-201ENSMUST00000036372 4176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Spry1-203ENSMUST00000108109 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Spry1-201ENSMUST00000038569 2481 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Ethe1-201ENSMUST00000077191 1484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Homer1-206ENSMUST00000109493 2580 ntTSL 5 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Nab2-201ENSMUST00000026469 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.22■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Set-201ENSMUST00000067996 2834 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Kcng2-201ENSMUST00000077962 2813 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Dleu2-204ENSMUST00000182286 666 ntTSL 2 BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Dleu2-213ENSMUST00000183245 637 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Hacd1-202ENSMUST00000091429 871 ntTSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Ubl3-201ENSMUST00000079324 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.21■□□□□ 0.83
Mterf1aQ8CHZ9 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 2310022B05Rik-201ENSMUST00000034464 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Klhl15-203ENSMUST00000113911 1227 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Slc9a3r2-201ENSMUST00000002572 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.2■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Lsr-203ENSMUST00000108116 2071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Cldnd1-204ENSMUST00000162057 1540 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Eif4e2-204ENSMUST00000113231 1119 ntTSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Tceal6-201ENSMUST00000033783 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Prdm13-202ENSMUST00000095141 3173 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.19■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Serpinh1-202ENSMUST00000169437 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Glipr2-201ENSMUST00000030202 2320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Wtap-204ENSMUST00000159986 3187 ntTSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC20.18■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Fam20b-202ENSMUST00000122424 4532 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Rxrb-201ENSMUST00000044858 2623 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Gm45051-201ENSMUST00000206838 963 ntTSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Gm9833-201ENSMUST00000061419 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Pdcd7-201ENSMUST00000048184 2419 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.17■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Kcnc3-201ENSMUST00000107906 5062 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.16■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Best2-201ENSMUST00000059072 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Zfp703-201ENSMUST00000127097 587 ntTSL 2 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Pdlim4-201ENSMUST00000018755 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Cox11-201ENSMUST00000020851 1224 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Stac-201ENSMUST00000035083 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.15■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Dynll2-201ENSMUST00000020775 2476 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.82
Mterf1aQ8CHZ9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.14■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Gm8098-201ENSMUST00000146985 1499 ntTSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Aif1l-201ENSMUST00000001920 3117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Rps2-ps13-201ENSMUST00000117295 882 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Gm12366-201ENSMUST00000121722 873 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Rps2-206ENSMUST00000146867 962 ntTSL 5 BASIC20.13■□□□□ 0.81
Mterf1aQ8CHZ9 Rps2-ps10-201ENSMUST00000076842 879 ntBASIC20.13■□□□□ 0.81
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 36.9 ms