Protein–RNA interactions for Protein: Q8CGC4

Lsm14b, Protein LSM14 homolog B, mousemouse

Known RBP Predictions only

Length 385 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Lsm14bQ8CGC4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Plk5-201ENSMUST00000039836 2112 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Adcy9-203ENSMUST00000120080 4974 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Tceal3-202ENSMUST00000113100 1148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Ybx2-205ENSMUST00000149194 1235 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Rexo2-210ENSMUST00000217037 609 ntTSL 3 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 AC153911.1-201ENSMUST00000220378 758 ntBASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Gse1-203ENSMUST00000120493 4610 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Krt79-201ENSMUST00000023799 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 AC122317.2-201ENSMUST00000218708 1248 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Ppa2-201ENSMUST00000029644 1226 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Gbx2-201ENSMUST00000036954 2135 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Aspscr1-203ENSMUST00000106158 1690 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Cacna2d2-205ENSMUST00000168532 5807 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 AC131739.1-201ENSMUST00000221692 1245 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Zdhhc5-201ENSMUST00000035840 4706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
Lsm14bQ8CGC4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 C130046K22Rik-201ENSMUST00000129780 727 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Jak2-202ENSMUST00000065796 5030 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Barhl1-203ENSMUST00000113849 2102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Ube2h-201ENSMUST00000094543 975 ntTSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Dirc2-201ENSMUST00000023554 5395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Thap4-206ENSMUST00000190116 5558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Azin2-203ENSMUST00000119354 1921 ntTSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Flt3l-211ENSMUST00000211429 1358 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Tmcc1-202ENSMUST00000088896 5838 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Pptc7-201ENSMUST00000053426 4644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Chtf8-205ENSMUST00000176515 694 ntTSL 2 BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Ammecr1-201ENSMUST00000041317 5437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 B230377A18Rik-202ENSMUST00000192921 1364 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Inpp5a-203ENSMUST00000106098 2826 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Dmrta2-201ENSMUST00000061187 2922 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Cacfd1-203ENSMUST00000114005 1286 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Terc-201ENSMUST00000082862 423 ntBASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 6330420H09Rik-201ENSMUST00000211371 1316 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Tbc1d2b-201ENSMUST00000041767 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Lsm14bQ8CGC4 B430319F04Rik-201ENSMUST00000209731 2669 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Cmas-201ENSMUST00000032419 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Spns2-201ENSMUST00000045303 3241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Pawr-201ENSMUST00000095313 1745 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Gm27021-201ENSMUST00000181333 758 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Kdm1a-203ENSMUST00000116273 3008 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Tmem164-206ENSMUST00000112896 5224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Cnnm1-201ENSMUST00000165311 5037 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 A030003K21Rik-201ENSMUST00000222600 830 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Lsm14bQ8CGC4 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 90.9 ms