Protein–RNA interactions for Protein: Q8CEG8

Usp27, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 27, mousemouse

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Length 438 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp27Q8CEG8 Kcnk2-205ENSMUST00000192723 1642 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Krtap17-1-201ENSMUST00000105049 761 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 A030005K14Rik-201ENSMUST00000193762 1093 ntAPPRIS P1 BASIC22■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Crct1-201ENSMUST00000029521 718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 A930035D04Rik-201ENSMUST00000064013 543 ntBASIC22■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Sephs1-202ENSMUST00000115019 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Tcte2-210ENSMUST00000148430 1839 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Igfbp7-201ENSMUST00000046746 1116 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Ndel1-201ENSMUST00000018880 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Hnrnpf-202ENSMUST00000163168 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Cdx1-201ENSMUST00000025521 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.99■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Dcbld1-201ENSMUST00000069004 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Stbd1-202ENSMUST00000200941 523 ntTSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Cyp4f15-201ENSMUST00000008801 2095 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Crtc2-201ENSMUST00000029545 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Ltb4r1-201ENSMUST00000057569 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.98■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Dennd6a-202ENSMUST00000203874 2677 ntTSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Cap2-205ENSMUST00000225824 1634 ntBASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Celf6-203ENSMUST00000118549 2973 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Kdf1-202ENSMUST00000105901 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Ybx3-202ENSMUST00000087865 1684 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.97■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Tmem98-201ENSMUST00000040865 1633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Mrps15-201ENSMUST00000030675 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Fbl-201ENSMUST00000042405 1197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Ctdsp1-201ENSMUST00000027367 2876 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.96■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Zfp821-201ENSMUST00000034163 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.11
Usp27Q8CEG8 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Tmem221-201ENSMUST00000052072 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 AC164433.2-201ENSMUST00000226346 1701 ntBASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Eml4-201ENSMUST00000049503 5109 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC21.95■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Dctpp1-201ENSMUST00000035276 676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Tbr1-202ENSMUST00000102737 1406 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Npas1-202ENSMUST00000210748 1959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Cdkn2aipnl-201ENSMUST00000102763 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Thap8-202ENSMUST00000108187 1184 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Gm28529-202ENSMUST00000189675 670 ntTSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 AI846148-201ENSMUST00000025924 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Ccnd3-201ENSMUST00000037333 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Hs3st6-201ENSMUST00000044922 1219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Gm9934-201ENSMUST00000098303 2077 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Osbp-201ENSMUST00000025590 4578 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Sirt1-207ENSMUST00000177694 3353 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Tead1-204ENSMUST00000106638 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Scarna2-201ENSMUST00000157560 414 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Uap1-202ENSMUST00000111350 2311 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Syde2-201ENSMUST00000039517 5495 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Parp12-201ENSMUST00000038398 3231 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Tbc1d24-201ENSMUST00000024931 4894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Fam20b-201ENSMUST00000086153 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Cdkl3-204ENSMUST00000109077 2605 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp27Q8CEG8 Bag2-201ENSMUST00000044691 1860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Fpgs-201ENSMUST00000028148 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Tatdn2-201ENSMUST00000089018 3096 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
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Usp27Q8CEG8 Mir3960-201ENSMUST00000198213 73 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 AC154454.1-201ENSMUST00000225253 216 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Fam105a-201ENSMUST00000100739 2867 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Zbtb4-203ENSMUST00000108640 4067 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Noc2l-201ENSMUST00000179543 2785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Cbfb-202ENSMUST00000109392 2891 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC21.89■■□□□ 1.1
Usp27Q8CEG8 AC125444.1-201ENSMUST00000223536 639 ntAPPRIS P1 BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Gm9806-201ENSMUST00000051080 552 ntBASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Tshz1-201ENSMUST00000060303 5656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Spint1-201ENSMUST00000028783 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Jak2-201ENSMUST00000025705 4947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Wrnip1-201ENSMUST00000021832 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Qsox2-201ENSMUST00000036187 2559 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Vegfb-202ENSMUST00000130048 1158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Gm37136-201ENSMUST00000194368 194 ntBASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Gm44957-202ENSMUST00000205137 448 ntTSL 3 BASIC21.88■■□□□ 1.09
Usp27Q8CEG8 Lrrc38-201ENSMUST00000052458 2324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
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