Protein–RNA interactions for Protein: Q8C878

Uba3, NEDD8-activating enzyme E1 catalytic subunit, mousemouse

Predictions only

Length 462 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Uba3Q8C878 Cdc42bpb-201ENSMUST00000041965 6714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Onecut3-201ENSMUST00000051773 4776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Usp21-203ENSMUST00000111306 2185 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Dyrk2-201ENSMUST00000004281 6129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Tmem150a-201ENSMUST00000069695 1546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Spats2-201ENSMUST00000063517 3065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.48■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Gm28536-201ENSMUST00000190971 1317 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Impdh1-201ENSMUST00000078155 2437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.47■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Fam168b-203ENSMUST00000167518 5058 ntTSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Gm27253-201ENSMUST00000183670 367 ntTSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
Uba3Q8C878 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Ccdc177-201ENSMUST00000073251 5775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Ube2k-204ENSMUST00000201292 1529 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Dcun1d5-202ENSMUST00000215683 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Pdgfa-204ENSMUST00000110897 1287 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Ube2q1-201ENSMUST00000038356 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Lrp2-202ENSMUST00000092551 2228 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Phf14-203ENSMUST00000115511 3336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.44■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Emc6-201ENSMUST00000054952 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Gm17641-201ENSMUST00000166328 2350 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Mpv17l2-201ENSMUST00000038626 980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Arglu1-201ENSMUST00000048545 3197 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Mpzl1-201ENSMUST00000068705 2171 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Apaf1-205ENSMUST00000160788 1596 ntTSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Phlpp1-201ENSMUST00000061047 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Hoxd11-202ENSMUST00000142312 1111 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Sec24d-208ENSMUST00000200333 307 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Grm2-203ENSMUST00000201681 2111 ntTSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Cited4-201ENSMUST00000094814 1249 ntAPPRIS P1 BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.41■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 AC102554.1-201ENSMUST00000216236 537 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Btbd6-206ENSMUST00000222209 644 ntTSL 3 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Srcap-202ENSMUST00000098025 1257 ntTSL 5 BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.4■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.18
Uba3Q8C878 Phf2os1-201ENSMUST00000123212 498 ntTSL 3 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Gm10653-201ENSMUST00000132250 1232 ntTSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Gm10653-203ENSMUST00000156423 1232 ntTSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 H2-Q5-202ENSMUST00000172979 998 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Cadps-203ENSMUST00000112658 5458 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.39■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Ltk-205ENSMUST00000140224 2240 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Ltk-206ENSMUST00000182203 2232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Smurf2-202ENSMUST00000103067 5290 ntTSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Fam98c-209ENSMUST00000164589 1293 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Kat2b-201ENSMUST00000000724 4653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Actr5-201ENSMUST00000045644 2402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Gm11847-201ENSMUST00000125165 1119 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Hnrnpa3-201ENSMUST00000090792 1140 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Efna3-203ENSMUST00000200436 742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Gm5812-201ENSMUST00000061073 957 ntBASIC22.36■■□□□ 1.17
Uba3Q8C878 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 25.6 ms