Protein–RNA interactions for Protein: Q8C4U3

Sfrp1, Secreted frizzled-related protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 314 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Sfrp1Q8C4U3 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Arhgef26-201ENSMUST00000079300 5638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Ndrg2-202ENSMUST00000111632 2103 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Rmdn2-208ENSMUST00000225357 2118 ntAPPRIS P1 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Wipi1-203ENSMUST00000106689 1220 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Gm42501-201ENSMUST00000200220 1026 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Lbx1-201ENSMUST00000099401 2484 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Gtf2h2-202ENSMUST00000066984 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
Sfrp1Q8C4U3 Tfpt-204ENSMUST00000155592 1091 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm18755-201ENSMUST00000218030 1099 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm28731-201ENSMUST00000185564 1569 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Spata6-213ENSMUST00000153746 1444 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Dusp1-201ENSMUST00000025025 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Gt(ROSA)26Sor-201ENSMUST00000124246 1181 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 4930524J08Rik-201ENSMUST00000046721 603 ntAPPRIS P1 BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Hlx-201ENSMUST00000048572 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Fkbp1b-201ENSMUST00000020964 976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Gga1-201ENSMUST00000041587 3034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Kif1bp-201ENSMUST00000065887 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Mtx1-202ENSMUST00000118964 1445 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Barx1-201ENSMUST00000021813 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Rps19-202ENSMUST00000108429 633 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Papola-211ENSMUST00000166735 1033 ntTSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Trim33-201ENSMUST00000029444 8875 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Fnta-201ENSMUST00000016138 1930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.35■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Rfx5-205ENSMUST00000107260 2355 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Kcnip2-202ENSMUST00000079431 2302 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Atp5j-202ENSMUST00000114191 742 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Zranb1-202ENSMUST00000106157 5008 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Rax-201ENSMUST00000025396 1669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Rnaset2b-202ENSMUST00000179728 2448 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.34■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Fam60a-202ENSMUST00000081956 2737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Pth2-201ENSMUST00000042754 503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC21.33■■□□□ 1.01
Sfrp1Q8C4U3 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Rtl10-201ENSMUST00000146673 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.32■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC21.32■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Pdf-201ENSMUST00000055316 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 D1Ertd622e-203ENSMUST00000149927 2703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.31■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 F930015N05Rik-201ENSMUST00000177999 1498 ntAPPRIS P1 BASIC21.31■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Cdkn2d-203ENSMUST00000215619 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Gm35161-201ENSMUST00000221765 941 ntTSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Stk19-201ENSMUST00000077477 1120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Gm10232-201ENSMUST00000089221 720 ntBASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Tlx2-201ENSMUST00000089641 1236 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 C1qtnf5-204ENSMUST00000114821 1365 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Zcchc11-201ENSMUST00000043368 6054 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC21.3■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Msc-201ENSMUST00000027062 1741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Slc18a3-201ENSMUST00000191501 2413 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Gm11614-201ENSMUST00000137598 736 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC21.29■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC21.28■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 AC153524.1-201ENSMUST00000220436 1935 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Prpsap2-201ENSMUST00000004955 1837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Gm14117-201ENSMUST00000122417 843 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Gm9959-201ENSMUST00000068277 390 ntBASIC21.28■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Pbx2-201ENSMUST00000038149 3068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.28■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Carm1-203ENSMUST00000115395 3152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.27■■□□□ 1
Sfrp1Q8C4U3 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC21.27■■□□□ 1
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 23.6 ms