Protein–RNA interactions for Protein: Q8BVF2

Pdcl3, Phosducin-like protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 240 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Pdcl3Q8BVF2 Ehmt2-201ENSMUST00000013931 4026 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm45855-201ENSMUST00000212546 880 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm37847-201ENSMUST00000192163 1497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm31748-201ENSMUST00000194938 1497 ntBASIC24.17■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Hira-201ENSMUST00000004222 4218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Amn-201ENSMUST00000021707 1701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Tmem102-201ENSMUST00000051025 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Krt82-201ENSMUST00000023713 2087 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Gna13-202ENSMUST00000106702 914 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Gm30023-201ENSMUST00000197970 889 ntBASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 5730507C01Rik-201ENSMUST00000063216 2431 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Rhoa-201ENSMUST00000007959 2197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 6430548M08Rik-202ENSMUST00000108948 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.16■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Ankrd40-203ENSMUST00000107818 3487 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Lsr-205ENSMUST00000205961 2021 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Nectin3-201ENSMUST00000023334 3062 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Ptpmt1-203ENSMUST00000125001 3183 ntTSL 1 (best) BASIC24.15■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 1700008J07Rik-201ENSMUST00000185351 2432 ntBASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Hs3st4-201ENSMUST00000106437 3189 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.14■■□□□ 1.46
Pdcl3Q8BVF2 Siah1b-202ENSMUST00000071667 1712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Rab5a-201ENSMUST00000017975 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Nkx2-1-202ENSMUST00000178477 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Magi3-202ENSMUST00000121198 5912 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.14■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Smox-207ENSMUST00000110186 2170 ntTSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Rpsa-204ENSMUST00000217317 1599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Stx2-202ENSMUST00000100680 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Dlx6os2-201ENSMUST00000178206 1354 ntBASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Phox2a-201ENSMUST00000008090 1609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Prpf19-201ENSMUST00000025642 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.13■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm26795-201ENSMUST00000180993 1952 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Esrra-201ENSMUST00000025906 2242 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Slc35f3-201ENSMUST00000108759 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Trak1-208ENSMUST00000210636 2197 ntTSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm38342-201ENSMUST00000195710 2980 ntBASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Gpr137c-205ENSMUST00000227009 771 ntAPPRIS ALT2 BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 1110008F13Rik-201ENSMUST00000029165 1045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Adora2b-201ENSMUST00000018644 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.12■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Papd7-202ENSMUST00000198607 4750 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Pex11b-202ENSMUST00000118557 2424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Cltb-202ENSMUST00000091609 2186 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Dmwd-202ENSMUST00000108479 2388 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Mtmr9-201ENSMUST00000058679 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Ankle1-201ENSMUST00000119976 2136 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Glrx3-201ENSMUST00000064404 1685 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Prph-201ENSMUST00000024249 1769 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Matn4-203ENSMUST00000109358 2056 ntTSL 5 BASIC24.11■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Agtpbp1-222ENSMUST00000171606 3037 ntTSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Cd83-201ENSMUST00000015540 2477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Kcnn2-208ENSMUST00000211323 2046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.1■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Mcu-202ENSMUST00000020312 2872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc34-201ENSMUST00000028580 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Syce2-202ENSMUST00000136026 1686 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Dnttip1-201ENSMUST00000017443 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Gm43545-201ENSMUST00000196765 2779 ntBASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Tead4-202ENSMUST00000112157 1909 ntTSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.09■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Bckdhb-201ENSMUST00000034801 1472 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Pcmtd1-201ENSMUST00000061280 5232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Osbpl1a-209ENSMUST00000122175 1203 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Krt76-201ENSMUST00000100179 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.45
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc50-201ENSMUST00000039443 2192 ntTSL 1 (best) BASIC24.08■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Hgsnat-201ENSMUST00000037609 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Ccdc102a-201ENSMUST00000077955 2304 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Spsb4-201ENSMUST00000055433 2720 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Gabra5-201ENSMUST00000068456 2671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC24.07■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Rfx8-202ENSMUST00000151913 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 1810049J17Rik-201ENSMUST00000180521 462 ntAPPRIS P1 BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Particl-201ENSMUST00000205370 1560 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 A830035O19Rik-201ENSMUST00000216147 1898 ntBASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Kmt2b-202ENSMUST00000108154 8454 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Kcns3-201ENSMUST00000055673 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Cdk2ap1-201ENSMUST00000031341 1315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.06■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Adprhl2-201ENSMUST00000102617 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Atp2b2-208ENSMUST00000205052 5658 ntTSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Vgf-204ENSMUST00000190827 2834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Nsmf-205ENSMUST00000114386 2685 ntTSL 5 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm9887-201ENSMUST00000053451 624 ntAPPRIS P1 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Ube2h-202ENSMUST00000102993 4657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Mast4-202ENSMUST00000164111 2350 ntTSL 2 BASIC24.05■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm9725-202ENSMUST00000166229 2326 ntTSL 5 BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Gm15441-202ENSMUST00000107095 1653 ntTSL 1 (best) BASIC24.04■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Tnks2-201ENSMUST00000025729 6481 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 1700003E16Rik-201ENSMUST00000032106 2020 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Hfe2-201ENSMUST00000049208 2028 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 1810026B05Rik-202ENSMUST00000184554 782 ntTSL 3 BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Nrtn-201ENSMUST00000044752 1023 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Pdcl3Q8BVF2 Dtnbp1-201ENSMUST00000072329 1362 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.03■■□□□ 1.44
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 22.1 ms