Protein–RNA interactions for Protein: Q8BMF5

Grik4, Glutamate receptor ionotropic, kainate 4, mousemouse

Predictions only

Length 956 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Grik4Q8BMF5 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Lrrc59-201ENSMUST00000021239 2837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Cep97-205ENSMUST00000121703 609 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 4930426I24Rik-202ENSMUST00000217797 1232 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 Gm9847-201ENSMUST00000052528 599 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Grik4Q8BMF5 H1f0-201ENSMUST00000180086 2287 ntAPPRIS P1 BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Eif5a-210ENSMUST00000108613 1343 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Ssr2-201ENSMUST00000035785 1189 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 2610307P16Rik-205ENSMUST00000148885 1870 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Taf11-202ENSMUST00000114848 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Ssbp1-203ENSMUST00000117411 933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Gm17324-201ENSMUST00000165499 922 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Hoxb7-201ENSMUST00000049352 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Eva1b-201ENSMUST00000052876 1689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 A730098A19Rik-201ENSMUST00000188193 978 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Nenf-201ENSMUST00000046770 742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Zgpat-202ENSMUST00000108807 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Gm43034-201ENSMUST00000198678 1364 ntBASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Traf3ip1-203ENSMUST00000189341 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Ankra2-205ENSMUST00000150916 1028 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Tmem230-201ENSMUST00000028816 1612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Gm16253-201ENSMUST00000148290 550 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 8430432A02Rik-201ENSMUST00000039080 1248 ntBASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Atp5a1-202ENSMUST00000114748 2674 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 St3gal2-202ENSMUST00000117534 2177 ntTSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Foxn3-209ENSMUST00000177451 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Ccnh-201ENSMUST00000022030 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.28■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Rcc1l-201ENSMUST00000076228 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Lsr-201ENSMUST00000001279 2167 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Gm960-204ENSMUST00000225896 2202 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Nsmf-213ENSMUST00000140737 862 ntTSL 5 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Tmem196-202ENSMUST00000183694 845 ntTSL 3 BASIC23.27■■□□□ 1.32
Grik4Q8BMF5 Fndc4-201ENSMUST00000041266 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.27■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 0610010K14Rik-209ENSMUST00000108579 667 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Gm21956-201ENSMUST00000179946 522 ntBASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.26■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Tk2-205ENSMUST00000212275 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Rfx5-204ENSMUST00000107255 2350 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Hnrnpab-202ENSMUST00000101249 2013 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.25■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Ubl3-204ENSMUST00000201595 2064 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Hoxb9-201ENSMUST00000000010 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Snrpa1-206ENSMUST00000153609 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Rem2-201ENSMUST00000164697 1194 ntTSL 5 BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Nxph3-201ENSMUST00000058866 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Pdcd4-201ENSMUST00000025931 2330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.24■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Ooep-201ENSMUST00000034900 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Gm12922-201ENSMUST00000120626 809 ntBASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Gm26558-201ENSMUST00000180559 861 ntAPPRIS P1 BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Bin1-202ENSMUST00000091967 2118 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.23■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Fbxw2-204ENSMUST00000113077 1670 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Clta-205ENSMUST00000107851 1135 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 2900079G21Rik-201ENSMUST00000139552 1139 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Spr-203ENSMUST00000174769 1029 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Irx1-201ENSMUST00000077337 2373 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Specc1-206ENSMUST00000201015 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Sh3rf1-201ENSMUST00000034060 5479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Tcte2-202ENSMUST00000127032 1875 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Prr7-201ENSMUST00000046533 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
Grik4Q8BMF5 Maz-201ENSMUST00000032916 2347 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Gm15202-201ENSMUST00000154188 393 ntTSL 3 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Zfp346-202ENSMUST00000159147 1146 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 5930403N24Rik-204ENSMUST00000217338 337 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Ctdspl-201ENSMUST00000073109 4589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Tmem191c-213ENSMUST00000164950 1394 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
Grik4Q8BMF5 Kcnk1-202ENSMUST00000212831 1309 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.5 ms