Protein–RNA interactions for Protein: Q8BJA2

Slc41a1, Solute carrier family 41 member 1, mousemouse

Predictions only

Length 512 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Slc41a1Q8BJA2 Dvl1-208ENSMUST00000168552 2776 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc41a1Q8BJA2 Acot3-202ENSMUST00000120927 1854 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc41a1Q8BJA2 Scamp3-202ENSMUST00000098941 1338 ntTSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc41a1Q8BJA2 Lrrc4b-201ENSMUST00000058667 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
Slc41a1Q8BJA2 Cox5b-204ENSMUST00000193210 865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc41a1Q8BJA2 Rab24-201ENSMUST00000035242 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc41a1Q8BJA2 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.27■■□□□ 1.16
Slc41a1Q8BJA2 Tirap-207ENSMUST00000177129 2366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Arhgap9-201ENSMUST00000069548 1782 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Bex1-202ENSMUST00000113118 754 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Yjefn3-202ENSMUST00000152938 785 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Tmem147-203ENSMUST00000207296 875 ntTSL 3 BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Ikbip-202ENSMUST00000020150 1328 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Rab3il1-202ENSMUST00000117641 2004 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 4933406I18Rik-202ENSMUST00000163996 904 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 1110065P20Rik-206ENSMUST00000185036 1223 ntTSL 2 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Gm45417-201ENSMUST00000209533 758 ntBASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Med25-205ENSMUST00000207278 2287 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Cadps-201ENSMUST00000067491 5421 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Timm8a1-201ENSMUST00000054213 1421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Gimap1-205ENSMUST00000204168 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Dctn3-203ENSMUST00000171641 885 ntTSL 3 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 AC061963.1-201ENSMUST00000213180 1765 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Fbxl14-201ENSMUST00000032094 2963 ntAPPRIS P1 BASIC22.24■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Purg-202ENSMUST00000078058 1795 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Clta-204ENSMUST00000107849 1099 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Gm45371-201ENSMUST00000210723 459 ntTSL 3 BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Bcl2l10-201ENSMUST00000034709 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Nfkbib-202ENSMUST00000085851 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Esyt2-201ENSMUST00000100986 5560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Hoxc13-201ENSMUST00000001700 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Smim19-201ENSMUST00000033935 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Csnk1a1-201ENSMUST00000115246 1484 ntTSL 5 BASIC22.22■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 B3gat1-203ENSMUST00000159799 2021 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Trim3-202ENSMUST00000106789 2841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Slc41a1Q8BJA2 Klhdc2-201ENSMUST00000021362 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Tmed2-201ENSMUST00000060226 2074 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Eif5a-202ENSMUST00000070996 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Ppp1cc-202ENSMUST00000102528 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Rnf19b-206ENSMUST00000168461 2532 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Gm11542-201ENSMUST00000126480 1511 ntTSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Plpp1-201ENSMUST00000016144 1598 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Ptx3-201ENSMUST00000029421 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.2■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Wwc1-201ENSMUST00000018993 4531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Ssbp4-201ENSMUST00000049908 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Krt10-201ENSMUST00000103131 2094 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.19■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Efr3a-203ENSMUST00000172756 1411 ntTSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Srm-201ENSMUST00000006611 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Gm29442-201ENSMUST00000188725 724 ntTSL 3 BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Sdsl-202ENSMUST00000052258 1225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.18■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Hook1-201ENSMUST00000030306 5517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Fam241b-203ENSMUST00000124615 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Tmem74b-201ENSMUST00000060196 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Ctage5-203ENSMUST00000170992 2785 ntTSL 1 (best) BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Abhd17b-201ENSMUST00000052556 2475 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.17■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Grb2-201ENSMUST00000021090 2709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Emc10-202ENSMUST00000118808 1872 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Cgrrf1-201ENSMUST00000068532 1324 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Insc-208ENSMUST00000169913 2321 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Gm10382-201ENSMUST00000100700 1233 ntAPPRIS P1 BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.16■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Tmem160-201ENSMUST00000019302 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Plpp5-201ENSMUST00000068916 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.15■■□□□ 1.14
Slc41a1Q8BJA2 Ttc39b-201ENSMUST00000030205 842 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Chst14-201ENSMUST00000099546 2090 ntAPPRIS P1 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Dok6-201ENSMUST00000097495 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.14■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Qtrt1-201ENSMUST00000002902 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.13■■□□□ 1.13
Slc41a1Q8BJA2 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC22.13■■□□□ 1.13
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 62.9 ms