Protein–RNA interactions for Protein: Q8BG18

Necab1, N-terminal EF-hand calcium-binding protein 1, mousemouse

Predictions only

Length 352 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Necab1Q8BG18 Mvb12b-201ENSMUST00000041555 4998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Slc9a2-201ENSMUST00000027231 5019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Ppp1r14c-201ENSMUST00000043374 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Frat1-201ENSMUST00000087155 2614 ntAPPRIS P1 BASIC23.48■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Ipmk-201ENSMUST00000079252 5447 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Slc35a3-201ENSMUST00000029569 5725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Dlg3-202ENSMUST00000087984 4956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.48■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Tab2-204ENSMUST00000146444 4380 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Cacna2d2-201ENSMUST00000010210 5783 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Krtap28-13-201ENSMUST00000188005 992 ntAPPRIS P1 BASIC23.47■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Hsd11b2-201ENSMUST00000034363 1840 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC23.47■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Rufy1-201ENSMUST00000020643 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Runx2os1-201ENSMUST00000097320 792 ntTSL 1 (best) BASIC23.46■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Tmem132b-201ENSMUST00000031446 7995 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.46■■□□□ 1.35
Necab1Q8BG18 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 4930526A20Rik-202ENSMUST00000142461 1628 ntBASIC23.45■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Gm10642-201ENSMUST00000098589 1610 ntAPPRIS P1 BASIC23.45■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Rarres1-201ENSMUST00000054825 1325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Atf5-201ENSMUST00000047356 1816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Hs6st3-201ENSMUST00000065904 1708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.45■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Olig3-201ENSMUST00000053225 2072 ntAPPRIS P1 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Trappc6b-203ENSMUST00000217863 797 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Ube2j2-202ENSMUST00000103175 1309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Plk5-202ENSMUST00000105351 2100 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Runx2-211ENSMUST00000162629 1607 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Retreg2-208ENSMUST00000190240 2438 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Mbnl3-203ENSMUST00000114876 2243 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Sema6d-204ENSMUST00000078621 6372 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Mbp-208ENSMUST00000114676 1685 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Rnf26-206ENSMUST00000216511 2257 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Zfp36l1-202ENSMUST00000165114 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Gpr25-201ENSMUST00000086395 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Mlf2-202ENSMUST00000180095 1475 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Mettl25-201ENSMUST00000046638 2033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Txndc9-207ENSMUST00000195032 1444 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Sh3rf3-202ENSMUST00000135526 1940 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Cyp2r1-202ENSMUST00000119712 917 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Rpl31-203ENSMUST00000179954 630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Cnnm4-201ENSMUST00000153128 4547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Dbf4-207ENSMUST00000171808 2402 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Tbxa2r-202ENSMUST00000220312 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Cys1-208ENSMUST00000189849 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Ndufs3-201ENSMUST00000005647 1046 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Smad4-201ENSMUST00000025393 3384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Nelfe-202ENSMUST00000165953 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Crlf2-201ENSMUST00000044579 1323 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.34
Necab1Q8BG18 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC23.39■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Rab26-202ENSMUST00000061764 1291 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 N4bp1-201ENSMUST00000034074 6469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Lrp3-202ENSMUST00000122409 4147 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Elavl1-201ENSMUST00000098950 5743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 4933408J17Rik-201ENSMUST00000181835 1859 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Atxn7l2-201ENSMUST00000102633 3044 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Slc35b2-205ENSMUST00000224905 1906 ntAPPRIS P1 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Tmem164-205ENSMUST00000112891 1654 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Hmgn3-202ENSMUST00000162246 983 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Gpr137c-207ENSMUST00000227086 4997 ntAPPRIS ALT2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Bmpr1a-201ENSMUST00000049005 5956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 E130218I03Rik-204ENSMUST00000131447 888 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
Necab1Q8BG18 Fbxw8-201ENSMUST00000049474 5000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Stradb-202ENSMUST00000114296 1348 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Dtnb-210ENSMUST00000173199 2820 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Efhd1os-201ENSMUST00000138844 332 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Dcun1d5-201ENSMUST00000034499 1122 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Tmem192-202ENSMUST00000079896 916 ntTSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
Necab1Q8BG18 Sirt1-203ENSMUST00000120239 4430 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 142.5 ms