Protein–RNA interactions for Protein: Q80UG8

Ttll4, Tubulin polyglutamylase TTLL4, mousemouse

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ttll4Q80UG8 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.03■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Tinagl1-209ENSMUST00000175992 1847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Foxc1-201ENSMUST00000062292 5844 ntAPPRIS P1 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Usf2-203ENSMUST00000162228 960 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Sec61a2-201ENSMUST00000026926 756 ntTSL 5 BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Plekhj1-201ENSMUST00000036805 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Tead2-202ENSMUST00000097216 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.02■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Triobp-201ENSMUST00000109687 2570 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.6
Ttll4Q80UG8 Nnat-207ENSMUST00000173041 760 ntTSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Nsun2-208ENSMUST00000176485 2408 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Trafd1-201ENSMUST00000042312 2503 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.01■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Peli3-201ENSMUST00000025834 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Gm35065-201ENSMUST00000199206 428 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Mef2a-203ENSMUST00000076325 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Zswim6-201ENSMUST00000105097 5456 ntTSL 5 BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Phf23-202ENSMUST00000101526 1706 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Lsm14b-201ENSMUST00000055485 2534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Git2-214ENSMUST00000155908 2338 ntTSL 5 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Tmem41a-201ENSMUST00000023562 1359 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 1700018A14Rik-201ENSMUST00000195587 711 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Gm40881-201ENSMUST00000223397 166 ntBASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Cdc42ep5-201ENSMUST00000076831 1025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Acbd6-203ENSMUST00000097529 1255 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Armc10-201ENSMUST00000072896 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Gemin7-203ENSMUST00000119912 653 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Ube2e3-202ENSMUST00000121433 1235 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Anp32e-210ENSMUST00000171368 878 ntTSL 3 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Gm10399-202ENSMUST00000202768 748 ntBASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Luc7l3-203ENSMUST00000107821 2050 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Krt72-201ENSMUST00000071104 1951 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Epb41l4b-203ENSMUST00000095076 6746 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Kcnq5-205ENSMUST00000173058 2472 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.59
Ttll4Q80UG8 Msl2-202ENSMUST00000189616 2612 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 1700051O22Rik-202ENSMUST00000195451 638 ntBASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Gpx7-202ENSMUST00000184609 331 ntTSL 3 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Fam220a-205ENSMUST00000169329 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Smox-205ENSMUST00000110182 985 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Strn3-202ENSMUST00000169503 2791 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Vkorc1l1-201ENSMUST00000051758 3112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Qk-202ENSMUST00000097414 4658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Agap3-201ENSMUST00000024123 3207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Spc24-201ENSMUST00000098942 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Smox-206ENSMUST00000110183 1159 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Arpp19-206ENSMUST00000168301 599 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Dleu2-201ENSMUST00000180377 1165 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Dleu2-209ENSMUST00000182957 352 ntTSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Pstpip1-201ENSMUST00000059206 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Scand1-201ENSMUST00000079125 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Ttll4Q80UG8 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Hmg20b-202ENSMUST00000105323 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Glp1r-201ENSMUST00000114574 1480 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Espn-207ENSMUST00000105653 1411 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Sumf1-203ENSMUST00000167338 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 1700020G03Rik-201ENSMUST00000211264 889 ntBASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Ttc36-201ENSMUST00000044694 888 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Htr6-201ENSMUST00000068036 1362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Pdgfb-201ENSMUST00000000500 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Ndufs2-201ENSMUST00000013737 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Arrdc2-201ENSMUST00000002989 2355 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Insm2-201ENSMUST00000051857 2660 ntAPPRIS P1 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Rgs10-205ENSMUST00000145739 564 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Gm2415-203ENSMUST00000149952 435 ntTSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Lrrc75a-201ENSMUST00000057194 1984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Trir-201ENSMUST00000047281 902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Ttll4Q80UG8 Tinagl1-203ENSMUST00000105999 1952 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 57.3 ms