Protein–RNA interactions for Protein: Q80UF9

Otop3, Otopetrin-3, mousemouse

Predictions only

Length 577 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Otop3Q80UF9 Hpca-209ENSMUST00000164649 1626 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.01■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Ankra2-202ENSMUST00000091356 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Sec63-201ENSMUST00000019937 6032 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Bean1-202ENSMUST00000164076 2423 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Pgls-205ENSMUST00000143441 1062 ntTSL 3 BASIC25■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Gm45102-201ENSMUST00000207427 857 ntBASIC25■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Fam216a-201ENSMUST00000031419 1388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Tmem120b-201ENSMUST00000067505 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 1700034P13Rik-201ENSMUST00000181358 1343 ntTSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC24.99■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Selenof-201ENSMUST00000082437 1514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Terf2-204ENSMUST00000133925 2666 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.99■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Susd6-203ENSMUST00000220238 2127 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Stub1-201ENSMUST00000044911 1672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Dgat2-201ENSMUST00000033001 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Slc15a4-201ENSMUST00000031367 2732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.98■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Dyrk1b-202ENSMUST00000172467 2523 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Dyrk1b-201ENSMUST00000085901 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Banp-202ENSMUST00000093078 2289 ntTSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Tmem74b-202ENSMUST00000109872 1399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Marc1-201ENSMUST00000048462 2039 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Zfp629-208ENSMUST00000151107 583 ntTSL 3 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Gm9748-202ENSMUST00000194881 783 ntTSL 2 BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 P3h3-201ENSMUST00000023958 2850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.97■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Arhgef25-205ENSMUST00000218654 2475 ntTSL 5 BASIC24.96■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 P4ha3-201ENSMUST00000057023 2361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC24.96■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Fam168b-201ENSMUST00000047534 5030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Bend6-201ENSMUST00000062289 2487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.59
Otop3Q80UF9 Pgbd5-204ENSMUST00000140012 3222 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Prrt2-206ENSMUST00000202045 429 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Bub3-205ENSMUST00000208571 747 ntTSL 5 BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Kcnip3-202ENSMUST00000088538 1296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Cdkl3-205ENSMUST00000109078 2216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.95■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Fbxo4-201ENSMUST00000022791 1565 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Gadd45a-207ENSMUST00000204369 716 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Mid2-201ENSMUST00000112988 2525 ntTSL 5 BASIC24.94■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.94■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Mgrn1-202ENSMUST00000070658 3290 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 A730035I17Rik-205ENSMUST00000205851 684 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 AC158990.1-201ENSMUST00000221450 2016 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Tmem120a-201ENSMUST00000043378 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Rhou-201ENSMUST00000045487 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Lipt2-201ENSMUST00000032967 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Ube2e3-201ENSMUST00000028398 2249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Clta-206ENSMUST00000170241 1079 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Gm5131-201ENSMUST00000212776 1238 ntBASIC24.92■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Phactr2-202ENSMUST00000105543 2735 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Lpcat4-201ENSMUST00000028554 2275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Kcna3-201ENSMUST00000052718 1902 ntAPPRIS P1 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Btbd2-202ENSMUST00000126980 2449 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.92■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Etf1-202ENSMUST00000180351 108 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Bloc1s5-202ENSMUST00000224115 1020 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 4930527J03Rik-201ENSMUST00000094270 543 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Gm10645-201ENSMUST00000098605 1090 ntAPPRIS P1 BASIC24.91■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Snrnp40-201ENSMUST00000105994 1584 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Ispd-204ENSMUST00000221452 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Kti12-201ENSMUST00000102738 1629 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Carm1-201ENSMUST00000034703 3220 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Dhrs13os-201ENSMUST00000150471 2429 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Rap1a-202ENSMUST00000197094 782 ntTSL 3 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Gm18190-203ENSMUST00000209944 389 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Pgp-201ENSMUST00000053024 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
Otop3Q80UF9 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Apcdd1-201ENSMUST00000096554 2799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Auh-204ENSMUST00000120535 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 D130058E05Rik-201ENSMUST00000173856 1372 ntTSL 2 BASIC24.89■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Ggnbp2-202ENSMUST00000100686 2275 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Psip1-202ENSMUST00000107214 1973 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Ltk-201ENSMUST00000028759 3080 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Zswim5-201ENSMUST00000044823 5582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Rp9-203ENSMUST00000215715 1499 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Txnrd2-213ENSMUST00000178093 1785 ntTSL 5 BASIC24.88■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Smurf1-201ENSMUST00000085684 5343 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC24.87■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 2210011C24Rik-204ENSMUST00000190457 1351 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 St6galnac6-205ENSMUST00000113290 2402 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Paqr3-203ENSMUST00000112969 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Foxj3-206ENSMUST00000138845 1530 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 C1ql2-201ENSMUST00000037286 2000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Pou4f1-201ENSMUST00000053016 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Ing2-201ENSMUST00000080353 2812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Clec3b-201ENSMUST00000026890 992 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Lypla2-201ENSMUST00000067567 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Hist2h2ab-201ENSMUST00000073115 444 ntAPPRIS P1 BASIC24.84■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.83■■□□□ 1.57
Otop3Q80UF9 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 59.7 ms