Protein–RNA interactions for Protein: Q80U62

Rubcn, Run domain Beclin-1-interacting and cysteine-rich domain-containing protein, mousemouse

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Length 956 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RubcnQ80U62 Fus-201ENSMUST00000077609 1831 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Cblc-202ENSMUST00000108449 1514 ntTSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Ptf1a-201ENSMUST00000028068 1508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Kcnk15-201ENSMUST00000044798 1199 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.93■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 AC122428.3-201ENSMUST00000215551 2290 ntBASIC24.93■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.92■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Gorasp2-203ENSMUST00000112205 1196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Med31-201ENSMUST00000021157 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Gm5874-201ENSMUST00000096101 508 ntBASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Reps1-206ENSMUST00000154718 2402 ntTSL 5 BASIC24.91■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Wdfy1-202ENSMUST00000113510 704 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Wdfy1-203ENSMUST00000113511 704 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 H2-Q7-204ENSMUST00000116598 1134 ntTSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 BC004004-202ENSMUST00000120346 1297 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Selenos-205ENSMUST00000206575 1157 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Wdfy1-201ENSMUST00000048820 717 ntTSL 1 (best) BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Sox3-201ENSMUST00000135107 2065 ntAPPRIS P1 BASIC24.9■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Gm3448-203ENSMUST00000179539 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Gm43137-201ENSMUST00000198052 594 ntBASIC24.89■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Gm3448-201ENSMUST00000097399 787 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.58
RubcnQ80U62 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Klhl25-205ENSMUST00000206019 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.89■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Sccpdh-201ENSMUST00000040538 1948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Ripply3-201ENSMUST00000023660 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.88■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Gm36033-202ENSMUST00000214827 745 ntTSL 2 BASIC24.88■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Csrp1-201ENSMUST00000027677 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Csrp1-202ENSMUST00000097561 1828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Sarnp-201ENSMUST00000105230 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Capn10-202ENSMUST00000117814 1268 ntTSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.87■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Mlycd-201ENSMUST00000098367 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Cdkn2a-202ENSMUST00000107131 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Mrgbp-206ENSMUST00000169630 1192 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Mir7075-201ENSMUST00000184187 82 ntBASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Smim19-202ENSMUST00000163774 1435 ntTSL 1 (best) BASIC24.86■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Mast2-203ENSMUST00000106485 5705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Mast2-204ENSMUST00000106486 5723 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Cdkn1c-202ENSMUST00000167912 1888 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.85■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.84■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Tmem189-201ENSMUST00000006587 2329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Spint2-201ENSMUST00000098604 1384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.84■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 2310015A10Rik-201ENSMUST00000180643 1399 ntTSL 1 (best) BASIC24.83■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Dleu2-211ENSMUST00000183066 788 ntTSL 3 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Gm3448-202ENSMUST00000097400 747 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.83■■□□□ 1.57
RubcnQ80U62 Snrpa-201ENSMUST00000080356 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Lgals3-201ENSMUST00000142734 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 4930444P10Rik-203ENSMUST00000151004 1001 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 6230400D17Rik-202ENSMUST00000224976 1019 ntBASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Tmem158-201ENSMUST00000068140 1712 ntAPPRIS P1 BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Mxra7-201ENSMUST00000021170 2063 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.82■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Ubtd1-201ENSMUST00000026170 1527 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Sirpa-209ENSMUST00000160276 876 ntTSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Kcnma1-215ENSMUST00000190339 890 ntTSL 5 BASIC24.81■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Cox14-201ENSMUST00000023761 723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Ttc9-201ENSMUST00000036116 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.81■■□□□ 1.56
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RubcnQ80U62 Gm7291-201ENSMUST00000199147 382 ntBASIC24.8■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Cyc1-201ENSMUST00000023210 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 H2-Q2-201ENSMUST00000074806 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Vamp4-204ENSMUST00000135241 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.8■■□□□ 1.56
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RubcnQ80U62 2310061I04Rik-203ENSMUST00000148482 1193 ntTSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Cited2-201ENSMUST00000038107 1979 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.79■■□□□ 1.56
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RubcnQ80U62 Pigp-204ENSMUST00000113914 912 ntTSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Bex4-201ENSMUST00000116527 837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Bola1-201ENSMUST00000016087 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Bola1-203ENSMUST00000177442 692 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Pigx-211ENSMUST00000189013 982 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Trnau1ap-201ENSMUST00000030730 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Pigx-201ENSMUST00000096109 993 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Porcn-201ENSMUST00000077595 1872 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.77■■□□□ 1.56
RubcnQ80U62 Ntsr2-201ENSMUST00000111064 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Ccdc9-202ENSMUST00000118976 2175 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Pnkd-204ENSMUST00000113805 740 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Rtn4rl2-201ENSMUST00000054514 1263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 E030030I06Rik-201ENSMUST00000069372 876 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Smox-202ENSMUST00000110179 1320 ntTSL 1 (best) BASIC24.76■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Gng2-202ENSMUST00000159028 458 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Dtd2-202ENSMUST00000085404 1012 ntTSL 1 (best) BASIC24.75■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Kctd17-201ENSMUST00000089414 1180 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.75■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 St7-209ENSMUST00000115420 2094 ntTSL 5 BASIC24.74■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Rtn4-210ENSMUST00000170731 1272 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Arv1-201ENSMUST00000034463 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Art1-201ENSMUST00000033300 1425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Acot3-203ENSMUST00000223080 1545 ntTSL 1 (best) BASIC24.74■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Zfp131-206ENSMUST00000223813 2561 ntAPPRIS P3 BASIC24.73■■□□□ 1.55
RubcnQ80U62 Fam196a-201ENSMUST00000171394 2490 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.73■■□□□ 1.55
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 643.7 ms