Protein–RNA interactions for Protein: Q7TNE1

Sugct, Succinate--hydroxymethylglutarate CoA-transferase, mousemouse

Predictions only

Length 436 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SugctQ7TNE1 Dnajb2-207ENSMUST00000188290 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Slc9a7-202ENSMUST00000115393 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.57■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.57■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Ipmk-203ENSMUST00000121446 1492 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.56■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Spag4-201ENSMUST00000038860 1473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Gm9934-202ENSMUST00000191246 1713 ntTSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Aktip-205ENSMUST00000125257 2079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Arpc2-201ENSMUST00000006467 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.56■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Mbd3-203ENSMUST00000105348 1222 ntTSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Gm27502-201ENSMUST00000183495 199 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 A230052G05Rik-201ENSMUST00000050921 2302 ntBASIC22.55■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Maf1-204ENSMUST00000160172 1537 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.55■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Nr5a1-202ENSMUST00000112883 2994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.55■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Gpr162-201ENSMUST00000046893 2676 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Ints11-201ENSMUST00000030901 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.54■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Inpp5a-201ENSMUST00000026550 2774 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Ccnjl-201ENSMUST00000050574 2672 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Nudt3-203ENSMUST00000114886 996 ntTSL 2 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 AC117769.4-201ENSMUST00000225679 685 ntBASIC22.53■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Bloc1s2-201ENSMUST00000079033 878 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Fra10ac1-201ENSMUST00000067167 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Etv4-202ENSMUST00000107176 2377 ntTSL 1 (best) BASIC22.53■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Etv4-201ENSMUST00000017868 2395 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.53■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 4930426D05Rik-204ENSMUST00000144487 1393 ntTSL 5 BASIC22.52■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Msrb1-201ENSMUST00000101800 1211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 AC151971.4-201ENSMUST00000214717 704 ntBASIC22.52■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Slc50a1-201ENSMUST00000029565 1022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Msto1-201ENSMUST00000107494 2093 ntTSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Dvl3-201ENSMUST00000003318 2498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.52■■□□□ 1.2
SugctQ7TNE1 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Tgfbrap1-202ENSMUST00000186694 5385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Nsmce4a-202ENSMUST00000160289 1435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Zfp639-202ENSMUST00000191783 1988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.51■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 A830092H15Rik-201ENSMUST00000099182 1229 ntBASIC22.51■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Susd3-203ENSMUST00000119721 1249 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.5■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Marc1-202ENSMUST00000110992 2152 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.5■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Tfg-201ENSMUST00000065515 1945 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Slc35a2-211ENSMUST00000208640 486 ntTSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Mapkapk2-201ENSMUST00000016672 2854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Kctd20-201ENSMUST00000057174 2368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Gm20458-201ENSMUST00000164863 1369 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.49■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Spsb3-209ENSMUST00000168265 1953 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.49■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Phf2-201ENSMUST00000035540 5494 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Ssx2ip-203ENSMUST00000106151 3232 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Ppp2r3d-202ENSMUST00000180270 450 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Cutc-201ENSMUST00000026199 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.48■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC22.48■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC22.48■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Spryd7-202ENSMUST00000100496 1459 ntTSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Usp2-206ENSMUST00000176416 1486 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 A430027H14Rik-201ENSMUST00000191809 1467 ntBASIC22.47■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Has1-201ENSMUST00000003762 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Tmem70-201ENSMUST00000065373 1710 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.47■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Lrrc1-205ENSMUST00000183873 3121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Fgf16-201ENSMUST00000033581 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Pmvk-201ENSMUST00000029564 1194 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Cbr3-201ENSMUST00000039620 1170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Rab21-201ENSMUST00000020343 4602 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.46■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Dusp26-205ENSMUST00000170204 1627 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Bin1-201ENSMUST00000025239 2451 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.46■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Gm26617-201ENSMUST00000180381 4429 ntTSL 3 BASIC22.45■■□□□ 1.19
SugctQ7TNE1 Hsf1-201ENSMUST00000072838 2018 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Kcnc3-202ENSMUST00000107907 5281 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.45■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 D17Wsu92e-201ENSMUST00000075076 1470 ntTSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Ankrd54-201ENSMUST00000040676 1904 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Polr2m-201ENSMUST00000034720 2200 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.45■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Gm13594-201ENSMUST00000137582 476 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Emc8-208ENSMUST00000181950 747 ntTSL 2 BASIC22.44■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Mau2-206ENSMUST00000212451 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Hscb-201ENSMUST00000056937 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 D030056L22Rik-202ENSMUST00000062753 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Kctd9-201ENSMUST00000078053 3157 ntTSL 1 (best) BASIC22.44■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Tmem45b-201ENSMUST00000048050 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Dusp2-201ENSMUST00000028846 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Gm14523-201ENSMUST00000117260 558 ntBASIC22.43■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 1700016H13Rik-204ENSMUST00000120688 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.43■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Snx5-201ENSMUST00000028909 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Ppp3cc-201ENSMUST00000078434 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.43■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Tysnd1-201ENSMUST00000020284 2286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Pan3-209ENSMUST00000176600 5541 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.42■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Gm15039-201ENSMUST00000118914 875 ntBASIC22.42■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Hoxd1-201ENSMUST00000047793 1862 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Sel1l3-201ENSMUST00000031090 4512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
SugctQ7TNE1 Gpr160-204ENSMUST00000108261 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.42■■□□□ 1.18
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 17.9 ms