Protein–RNA interactions for Protein: Q6PG04

Ccdc82, Coiled-coil domain-containing protein 82, mousemouse

Predictions only

Length 518 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ccdc82Q6PG04 Hey1-201ENSMUST00000042412 2423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.69■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Dleu7-201ENSMUST00000063169 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Gm37415-201ENSMUST00000192265 2054 ntBASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Nudt6-204ENSMUST00000108118 935 ntTSL 5 BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Ildr2-202ENSMUST00000192426 1238 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Nudt6-201ENSMUST00000052645 1155 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Rnaset2b-201ENSMUST00000089119 1013 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Nudt6-202ENSMUST00000099130 1070 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.67■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Exosc8-201ENSMUST00000029316 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Hopx-203ENSMUST00000120827 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Sft2d1-210ENSMUST00000154553 1049 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 St3gal5-202ENSMUST00000114112 2439 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.66■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Mpzl1-202ENSMUST00000111435 2285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Dennd5a-201ENSMUST00000080437 5004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Ube2b-201ENSMUST00000020657 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Gm45095-201ENSMUST00000206736 254 ntTSL 5 BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Lyar-201ENSMUST00000087514 1563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.65■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Cntln-202ENSMUST00000102819 2239 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Hpf1-204ENSMUST00000146863 531 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Gm43592-201ENSMUST00000196922 1165 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Bri3-201ENSMUST00000056578 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Gm5921-201ENSMUST00000075898 882 ntBASIC24.64■■□□□ 1.54
Ccdc82Q6PG04 Zc3h6-201ENSMUST00000110319 1484 ntTSL 1 (best) BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC24.64■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Neurl4-211ENSMUST00000177138 4886 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 P2rx2-203ENSMUST00000195985 2096 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Ppcs-201ENSMUST00000030385 1443 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Sh3bp1-203ENSMUST00000089378 2001 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Rell2-201ENSMUST00000070709 1767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Scarb1-202ENSMUST00000111390 2367 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Tle1-205ENSMUST00000107337 2067 ntTSL 1 (best) BASIC24.63■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Dpysl3-201ENSMUST00000025379 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Gm42418-201ENSMUST00000182010 1831 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.62■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Ccdc88a-202ENSMUST00000109477 1716 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Gm15334-201ENSMUST00000131421 325 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Dbp-203ENSMUST00000211357 1252 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Nsd1-206ENSMUST00000224918 1001 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Txnrd2-212ENSMUST00000177856 1878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Gtpbp6-201ENSMUST00000077220 1617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Btf3l4-203ENSMUST00000102741 1033 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Gm10420-201ENSMUST00000121713 882 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Shox2-204ENSMUST00000162439 1081 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Ube2k-206ENSMUST00000201984 1449 ntTSL 3 BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Morf4l1-201ENSMUST00000085248 1882 ntTSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Kcnmb4os2-203ENSMUST00000127070 1048 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Tmem127-202ENSMUST00000174288 842 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Arhgap39-204ENSMUST00000176219 542 ntTSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Vcpkmt-201ENSMUST00000058639 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Mrpl48-207ENSMUST00000146003 1625 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Ctsz-201ENSMUST00000016400 1441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Otud3-201ENSMUST00000097830 1668 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Cotl1-201ENSMUST00000034285 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Fcho2-201ENSMUST00000040340 5122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
Ccdc82Q6PG04 Hmbox1-204ENSMUST00000175905 1715 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Aldoa-214ENSMUST00000207534 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Eif2b3-203ENSMUST00000106448 1555 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Rab26-201ENSMUST00000035797 1575 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Maf1-211ENSMUST00000161527 1743 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Fam50b-202ENSMUST00000221037 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Oaz2-201ENSMUST00000046490 1840 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Whrn-208ENSMUST00000119294 2632 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Trip10-207ENSMUST00000224947 2016 ntAPPRIS P2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Mpnd-204ENSMUST00000149441 1701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 H1fx-201ENSMUST00000056403 1217 ntAPPRIS P1 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Gm26796-201ENSMUST00000181092 2276 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Gm20431-201ENSMUST00000125544 2367 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Jdp2-201ENSMUST00000050687 1643 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Eml4-202ENSMUST00000096766 5445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Stmn4-204ENSMUST00000121955 1361 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Nipa1-201ENSMUST00000052204 3183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Mpnd-209ENSMUST00000162883 1400 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Ubl4a-206ENSMUST00000155676 2442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Adssl1-201ENSMUST00000021726 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Ptpn12-201ENSMUST00000030556 3280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Rbm34-203ENSMUST00000212618 1509 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Zfp579-201ENSMUST00000108572 2157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Slc35b3-209ENSMUST00000225432 2216 ntAPPRIS P3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
Ccdc82Q6PG04 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Fkbp8-201ENSMUST00000075491 1698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Ccdc82Q6PG04 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 20.2 ms