Protein–RNA interactions for Protein: Q6PDI5

Ecm29, Proteasome-associated protein ECM29 homolog, mousemouse

Predictions only

Length 1,840 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Ecm29Q6PDI5 Lrrc24-201ENSMUST00000036247 1758 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 2810025M15Rik-201ENSMUST00000061537 1194 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Dleu2-203ENSMUST00000182259 1437 ntTSL 1 (best) BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 2810001G20Rik-202ENSMUST00000146333 959 ntTSL 3 BASIC25.65■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Gm26776-201ENSMUST00000180479 1872 ntTSL 5 BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Vps37b-201ENSMUST00000040967 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 1700016H13Rik-205ENSMUST00000134926 1104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 Tcte2-201ENSMUST00000053376 1105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.7
Ecm29Q6PDI5 E130311K13Rik-201ENSMUST00000061706 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.64■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Tpm1-206ENSMUST00000113686 998 ntTSL 5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Proca1-201ENSMUST00000060539 960 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Ube2g2-204ENSMUST00000174510 2031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Igfbp3-201ENSMUST00000020702 2421 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Pigx-210ENSMUST00000155966 963 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Gm4553-202ENSMUST00000210925 1044 ntAPPRIS P5 BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Ankrd11-207ENSMUST00000212937 943 ntTSL 1 (best) BASIC25.63■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Letm2-209ENSMUST00000210810 1538 ntTSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Dlk2-204ENSMUST00000170271 1783 ntTSL 5 BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Alkal2-201ENSMUST00000067087 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.62■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Abhd17c-201ENSMUST00000117085 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Gm5297-201ENSMUST00000198555 1171 ntBASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Dgcr6-201ENSMUST00000066027 1050 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 6330562C20Rik-201ENSMUST00000098867 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Prr3-201ENSMUST00000055454 2727 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.61■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Zc3h8-201ENSMUST00000028866 1624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 St6galnac6-203ENSMUST00000095044 2394 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Sh3d21-202ENSMUST00000097891 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Bbc3-201ENSMUST00000002152 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Ier5l-201ENSMUST00000065134 2683 ntAPPRIS P1 BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 BC022687-201ENSMUST00000037014 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Tmpo-204ENSMUST00000099355 1953 ntTSL 1 (best) BASIC25.6■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Alad-201ENSMUST00000030090 1206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Tmem260-210ENSMUST00000227440 2222 ntAPPRIS ALT2 BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Zfand2b-201ENSMUST00000027394 1316 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 4933440N22Rik-202ENSMUST00000204444 1952 ntBASIC25.59■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 4930439D14Rik-201ENSMUST00000186765 359 ntBASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Bag1-204ENSMUST00000215842 1068 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Tex30-208ENSMUST00000147571 1360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Manf-202ENSMUST00000159283 2247 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Tsen34-202ENSMUST00000108627 1319 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 E330009J07Rik-201ENSMUST00000039008 1949 ntTSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Tifa-202ENSMUST00000163775 1646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.58■■□□□ 1.69
Ecm29Q6PDI5 Chml-203ENSMUST00000210367 1324 ntTSL 5 BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Btbd6-201ENSMUST00000002880 2057 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Htra1-201ENSMUST00000006367 2041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Jagn1-201ENSMUST00000101070 1201 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Gm9780-202ENSMUST00000184915 1394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Mmadhc-201ENSMUST00000102769 1342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Fbxl5-205ENSMUST00000121736 2144 ntTSL 1 (best) BASIC25.57■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Pdcd5-201ENSMUST00000118501 684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Gp1bb-201ENSMUST00000051160 645 ntAPPRIS P3 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Rps19bp1-201ENSMUST00000052499 830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Krtap5-2-201ENSMUST00000067978 937 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Gm10620-201ENSMUST00000098379 1332 ntBASIC25.56■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Tmem59-202ENSMUST00000106753 1148 ntTSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Ppp1r18os-201ENSMUST00000145804 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Igfbp7-202ENSMUST00000163898 1200 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Ccdc74a-201ENSMUST00000056962 1273 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.56■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Mblac1-201ENSMUST00000057773 1308 ntAPPRIS P1 BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Anp32b-201ENSMUST00000102926 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Ubp1-204ENSMUST00000214095 2320 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Mrpl16-201ENSMUST00000167199 1122 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Gm1673-201ENSMUST00000094869 477 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Fam204a-201ENSMUST00000065286 2035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.55■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Pet117-201ENSMUST00000183618 693 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Pbx1-201ENSMUST00000064438 1020 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Shisa5-201ENSMUST00000026737 1834 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Efhd2-201ENSMUST00000036854 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Htra2-201ENSMUST00000089645 1725 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC25.54■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Ikzf1-202ENSMUST00000048122 911 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 2410022M11Rik-201ENSMUST00000186474 1911 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Txnrd2-214ENSMUST00000205679 1866 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Slc35b2-207ENSMUST00000226086 850 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Podxl2-210ENSMUST00000145944 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 4933431K14Rik-201ENSMUST00000195799 1352 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Endod1-203ENSMUST00000214236 419 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 1810010H24Rik-202ENSMUST00000140447 1677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Tusc2-201ENSMUST00000010198 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
Ecm29Q6PDI5 Tm2d1-202ENSMUST00000102793 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Gm14424-201ENSMUST00000143191 895 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Gm20522-201ENSMUST00000173576 784 ntTSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Pink1-203ENSMUST00000105817 1711 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Jtb-202ENSMUST00000119304 878 ntTSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Psmg4-202ENSMUST00000147632 555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 0610039K10Rik-202ENSMUST00000184724 952 ntBASIC25.51■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Rab40b-201ENSMUST00000106107 1861 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Nfkbil1-201ENSMUST00000048994 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Josd2-211ENSMUST00000134398 563 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Kiss1-203ENSMUST00000193888 624 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Rasl10b-201ENSMUST00000021022 996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Rem1-201ENSMUST00000000369 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Mecp2-201ENSMUST00000033770 1739 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Rfxap-201ENSMUST00000044373 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Nisch-222ENSMUST00000172142 2780 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Ecm29Q6PDI5 Nol7-205ENSMUST00000222499 756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 104.4 ms