Protein–RNA interactions for Protein: Q6NS82

Retreg2, Reticulophagy regulator 2, mousemouse

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Retreg2Q6NS82 Gabbr2-201ENSMUST00000107749 5750 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Stk32c-201ENSMUST00000016125 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Gm7199-201ENSMUST00000118327 1485 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 E130307A14Rik-201ENSMUST00000129191 2011 ntTSL 3 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Sds-204ENSMUST00000201684 1288 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Gadd45g-201ENSMUST00000021903 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Ppp5c-201ENSMUST00000003183 2072 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Pkp2-203ENSMUST00000162150 1959 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Epb41l4b-201ENSMUST00000030142 3247 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Fbxl3-204ENSMUST00000132004 2534 ntTSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Arnt2-201ENSMUST00000085077 6151 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Gm10837-201ENSMUST00000100294 1536 ntAPPRIS P1 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Ubl7-208ENSMUST00000216841 1426 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Gm11492-201ENSMUST00000060360 1972 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Acss2-203ENSMUST00000103142 2145 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Gm26775-201ENSMUST00000180684 2197 ntTSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Socs2-202ENSMUST00000119917 948 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Hrasls-204ENSMUST00000162747 854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Magi2-201ENSMUST00000088516 4843 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 1700034H15Rik-201ENSMUST00000069573 1461 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Prpsap2-204ENSMUST00000168115 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 0610009L18Rik-201ENSMUST00000143813 619 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Unc119-201ENSMUST00000002127 1329 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Mettl9-201ENSMUST00000033163 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Tmem238-201ENSMUST00000168578 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Marcksl1-201ENSMUST00000062356 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Etv4-212ENSMUST00000164750 2336 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
Retreg2Q6NS82 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Metrnl-201ENSMUST00000036742 1401 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Acad9-205ENSMUST00000196648 552 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 BC005561-201ENSMUST00000096452 5409 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Inafm2-201ENSMUST00000149978 3053 ntAPPRIS P1 BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Sac3d1-201ENSMUST00000113533 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Mfn1-201ENSMUST00000091257 4562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Ksr1-201ENSMUST00000018478 5495 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Get4-201ENSMUST00000026976 2107 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Ppp1r12c-201ENSMUST00000013886 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Cacnb3-202ENSMUST00000109150 2670 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 BC037034-201ENSMUST00000048421 2490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Pantr1-205ENSMUST00000177136 1543 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Camk2n2-201ENSMUST00000052939 1291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Slc35e2-203ENSMUST00000118607 2166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 6430628N08Rik-201ENSMUST00000132221 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Capns1-203ENSMUST00000126116 1429 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Dynlrb1-204ENSMUST00000150602 788 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 1700097N02Rik-201ENSMUST00000188852 845 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Sarnp-203ENSMUST00000219512 953 ntTSL 3 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Vegfb-201ENSMUST00000025914 1281 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Ctxn1-201ENSMUST00000053252 1212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Dcbld2-201ENSMUST00000046663 6561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Lrrc10b-201ENSMUST00000171400 2077 ntAPPRIS P1 BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Ttc6-201ENSMUST00000101398 1484 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Mrfap1-201ENSMUST00000068795 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Tmem164-204ENSMUST00000112889 1742 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Gm20387-201ENSMUST00000173609 1783 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Fam96b-203ENSMUST00000164884 918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Coq2-201ENSMUST00000031262 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Eri3-201ENSMUST00000037127 1719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Borcs6-201ENSMUST00000051888 1862 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 4833418N17Rik-201ENSMUST00000064826 615 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Tmem55b-206ENSMUST00000161166 1445 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Homer1-207ENSMUST00000109494 2468 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Gm6277-202ENSMUST00000224036 2779 ntBASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Jund-201ENSMUST00000095267 1668 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
Retreg2Q6NS82 Fam102b-202ENSMUST00000171143 5702 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Ptpn18-201ENSMUST00000027302 1559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 AC153962.1-201ENSMUST00000218530 1948 ntBASIC22.7■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Sec22c-202ENSMUST00000111560 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Slc10a3-201ENSMUST00000037967 2023 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Ccdc84-212ENSMUST00000217351 888 ntTSL 3 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Rps24-207ENSMUST00000224568 714 ntBASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Mt2-201ENSMUST00000034214 511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Gm9767-201ENSMUST00000041011 1193 ntAPPRIS P1 BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Cacybp-201ENSMUST00000014370 2098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Adgrb1-201ENSMUST00000042035 6228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Eef1a2-201ENSMUST00000055990 2084 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.69■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Mapk12-201ENSMUST00000088827 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Mindy2-202ENSMUST00000213380 2521 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Tmem150b-201ENSMUST00000086363 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Fgf8-206ENSMUST00000111928 1056 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Casd1-204ENSMUST00000181734 1063 ntTSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 A930002H24Rik-201ENSMUST00000050753 492 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Fbxl17-201ENSMUST00000024761 4925 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Cadps-202ENSMUST00000112657 5455 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
Retreg2Q6NS82 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 50.6 ms