Protein–RNA interactions for Protein: Q6IFT4

Arhgap20, Rho GTPase-activating protein 20, mousemouse

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Arhgap20Q6IFT4 Skor2-201ENSMUST00000166956 3141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Rpl38-203ENSMUST00000106599 457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gadd45a-201ENSMUST00000043098 1223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Rasgrf2-206ENSMUST00000216219 2115 ntTSL 5 BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 2010300C02Rik-203ENSMUST00000162875 4634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.02■□□□□ 0.96
Arhgap20Q6IFT4 Gm5475-201ENSMUST00000132119 2608 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Qdpr-201ENSMUST00000015950 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Gm11687-201ENSMUST00000118911 886 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Gm16437-201ENSMUST00000025669 507 ntBASIC21.01■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Id3-201ENSMUST00000008016 1278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Fam19a5-201ENSMUST00000068088 2575 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 AC123857.1-201ENSMUST00000181053 2312 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Dpf1-201ENSMUST00000049977 2309 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 B4galt1-202ENSMUST00000108096 1413 ntTSL 1 (best) BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Gm45869-201ENSMUST00000210335 1704 ntTSL 5 BASIC21.01■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 AC117245.4-201ENSMUST00000217388 1646 ntBASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Socs2-213ENSMUST00000170690 2195 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Vamp4-206ENSMUST00000150040 901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Psmg1-201ENSMUST00000023630 1044 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Faap24-201ENSMUST00000032704 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Btbd19-209ENSMUST00000183310 1620 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Rcor3-206ENSMUST00000192491 1623 ntTSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Cars2-201ENSMUST00000049461 1902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Galr2-201ENSMUST00000055872 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Chrna7-201ENSMUST00000032738 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Gorasp2-201ENSMUST00000028509 2238 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Nkx2-2-201ENSMUST00000067075 2120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Kcnq5-201ENSMUST00000029667 6562 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Dvl1-201ENSMUST00000030948 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Trpc1-201ENSMUST00000053785 2912 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Socs2-201ENSMUST00000020215 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Wbp1-208ENSMUST00000151393 837 ntTSL 3 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Gjd3-201ENSMUST00000062931 837 ntAPPRIS P1 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Cadm1-206ENSMUST00000143026 1643 ntTSL 5 BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Arpc5l-202ENSMUST00000112862 1339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.99■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Slc26a10-201ENSMUST00000095270 2215 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Mcoln1-201ENSMUST00000004683 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Map3k15-201ENSMUST00000033665 4348 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Sft2d3-201ENSMUST00000054984 2810 ntAPPRIS P1 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Kcnn2-203ENSMUST00000169783 1625 ntTSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Card19-201ENSMUST00000048946 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Wnt5b-204ENSMUST00000178696 2371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Cept1-203ENSMUST00000121231 2121 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC20.98■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Usf1-210ENSMUST00000167546 1822 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Rfng-201ENSMUST00000026156 2118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Ghitm-201ENSMUST00000042564 2573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Dpy19l1-206ENSMUST00000170356 4715 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Fbxw2-203ENSMUST00000113075 2260 ntTSL 1 (best) BASIC20.97■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Retreg2-201ENSMUST00000097694 2561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Lemd3-202ENSMUST00000119944 4743 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Doc2a-201ENSMUST00000064110 2538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Man1a-201ENSMUST00000003843 5137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Psmb8-201ENSMUST00000025196 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Sephs2-201ENSMUST00000082428 2177 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Bhlhe23-201ENSMUST00000108878 2520 ntAPPRIS P1 BASIC20.96■□□□□ 0.95
Arhgap20Q6IFT4 Hsf1-205ENSMUST00000227478 2084 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Ubtf-213ENSMUST00000178839 4580 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Arf4-201ENSMUST00000022429 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Hyal2-201ENSMUST00000010191 1893 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Nrbp2-208ENSMUST00000228366 1863 ntAPPRIS P1 BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Ccdc61-201ENSMUST00000098780 2022 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Msx3-202ENSMUST00000172775 2070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Sept5-201ENSMUST00000096987 2127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.95■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Puf60-202ENSMUST00000100527 1878 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Map2k1-201ENSMUST00000005066 2436 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Gm44428-201ENSMUST00000204474 874 ntBASIC20.94■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Neurl4-202ENSMUST00000108617 4892 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Hmox2-202ENSMUST00000118885 1392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Snapin-203ENSMUST00000149884 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Raph1-202ENSMUST00000090293 2409 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Smad6-201ENSMUST00000041029 2971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.94■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Oaf-201ENSMUST00000034512 2526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Ezh2-203ENSMUST00000114616 2670 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC20.93■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 C1galt1-201ENSMUST00000040159 6092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Nle1-201ENSMUST00000103213 1783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Ypel1-201ENSMUST00000035682 3322 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Lmtk3-202ENSMUST00000120005 4997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Slc12a8-204ENSMUST00000121925 2656 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Rell2-211ENSMUST00000176902 1835 ntTSL 5 BASIC20.92■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Brd1-203ENSMUST00000109381 4886 ntTSL 5 BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Rnf111-204ENSMUST00000213647 4961 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Kremen2-201ENSMUST00000046525 2123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.91■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Bola3-207ENSMUST00000136501 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Trim47-201ENSMUST00000021120 2204 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Fbxw2-201ENSMUST00000028220 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Krt8-201ENSMUST00000023952 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Klf2-201ENSMUST00000067912 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Maf1-201ENSMUST00000023212 1686 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 2700081O15Rik-202ENSMUST00000159348 4989 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Gm39157-201ENSMUST00000212322 1180 ntTSL 5 BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Phc2-202ENSMUST00000106079 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Arhgap23-201ENSMUST00000093940 2409 ntTSL 1 (best) BASIC20.9■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Chst12-201ENSMUST00000043050 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Plpp5-207ENSMUST00000139836 1539 ntTSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Bfsp1-202ENSMUST00000099296 2160 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Ell3-201ENSMUST00000028679 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Man1a-203ENSMUST00000105470 2847 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.89■□□□□ 0.94
Arhgap20Q6IFT4 Srsf2-206ENSMUST00000190993 1326 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.89■□□□□ 0.93
Arhgap20Q6IFT4 Iglon5-201ENSMUST00000107974 2622 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.89■□□□□ 0.93
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 12.4 ms