Protein–RNA interactions for Protein: Q6A4J8

Usp7, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 7, mousemouse

Predictions only

Length 1,103 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Usp7Q6A4J8 Pfdn4-204ENSMUST00000109148 736 ntTSL 3 BASIC21.2■□□□□ 0.98
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Usp7Q6A4J8 Polr1d-201ENSMUST00000050970 1196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Sdccag3-201ENSMUST00000028293 2031 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.2■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Opn3-201ENSMUST00000027809 1913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Foxb2-201ENSMUST00000072915 1515 ntAPPRIS P1 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Dact1-202ENSMUST00000150639 2448 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Usp7Q6A4J8 Cbln1-202ENSMUST00000169693 1699 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Mbd3-201ENSMUST00000092295 1662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Socs1-201ENSMUST00000038099 1220 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Kcnk12-201ENSMUST00000055221 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.19■□□□□ 0.98
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Usp7Q6A4J8 Rps2-ps6-201ENSMUST00000095471 855 ntBASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Cdan1-201ENSMUST00000110700 5996 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Ccdc9-201ENSMUST00000041010 2379 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Slc25a1-201ENSMUST00000003622 1678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.18■□□□□ 0.98
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Usp7Q6A4J8 A230087F16Rik-201ENSMUST00000181055 2098 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Tmem143-201ENSMUST00000069772 2297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 H3f3a-207ENSMUST00000162814 724 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Gm28417-201ENSMUST00000185218 785 ntTSL 3 BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp7Q6A4J8 Sin3b-203ENSMUST00000212095 1257 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Eva1b-203ENSMUST00000106152 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Pou2f2-204ENSMUST00000108416 1754 ntTSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
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Usp7Q6A4J8 Hoxa11-201ENSMUST00000048026 2287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Irak1-202ENSMUST00000068286 2537 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.17■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Syt6-204ENSMUST00000118563 1843 ntTSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Snrpb-201ENSMUST00000103199 1161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.16■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Ltb-203ENSMUST00000173600 905 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.16■□□□□ 0.98
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Usp7Q6A4J8 Nrxn1-213ENSMUST00000172466 2477 ntTSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Zfand2b-204ENSMUST00000160439 1206 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.15■□□□□ 0.98
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Usp7Q6A4J8 Macrod2-206ENSMUST00000110064 4883 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.15■□□□□ 0.98
Usp7Q6A4J8 Psmd7-201ENSMUST00000044106 1581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Usp7Q6A4J8 Nrarp-201ENSMUST00000104999 2582 ntAPPRIS P1 BASIC21.14■□□□□ 0.98
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Usp7Q6A4J8 Mprip-202ENSMUST00000072031 8718 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Ptpn4-203ENSMUST00000163435 2365 ntTSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Usp7Q6A4J8 Slc36a1-201ENSMUST00000020499 1950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.14■□□□□ 0.97
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Usp7Q6A4J8 B4galt6-201ENSMUST00000070080 5808 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 AC124392.1-201ENSMUST00000225172 5324 ntBASIC21.1■□□□□ 0.97
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Usp7Q6A4J8 Smco4-203ENSMUST00000215907 994 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
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Usp7Q6A4J8 Syncrip-201ENSMUST00000069221 9450 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Sh2d4b-202ENSMUST00000096000 1597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.1■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Sdccag3-204ENSMUST00000114102 2193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Ppp1r14a-202ENSMUST00000207714 755 ntTSL 3 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Ppp1r14a-201ENSMUST00000048187 950 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Serp2-201ENSMUST00000064517 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 March5-201ENSMUST00000024078 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Rfwd2-201ENSMUST00000076894 5116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Cntln-204ENSMUST00000169371 5365 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Pdp1-201ENSMUST00000056050 1881 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Mrgbp-201ENSMUST00000029085 1510 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Ttc7b-201ENSMUST00000062957 3446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.09■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Naxd-202ENSMUST00000177955 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Nckap1-202ENSMUST00000111760 4597 ntTSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Gm16464-201ENSMUST00000117815 1095 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Dynlt1f-201ENSMUST00000179554 807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Gm7417-201ENSMUST00000192950 473 ntBASIC21.08■□□□□ 0.97
Usp7Q6A4J8 Dlx2-201ENSMUST00000024159 2473 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.08■□□□□ 0.97
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